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wiflash

[交流] 求助:基因序列未知,引物该怎么设计

宋体我的基因只知道外显子的序列,但是不知道内含子的序列,我想扩增这个基因的全部外显子,不知道应该怎么设计引物,我提取的是DNA,如果不用RNA做,有没有办法,热切盼回帖,谢谢。

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iamboy

金虫 (小有名气)

可以啊,可以考虑兼并引物。
6楼2006-04-03 20:25:31
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查看全部 9 个回答

wj_21cn

木虫 (正式写手)

晕,模板的序列都不知道,怎么设计引物呢?
不过直到外显子的序列的话。
只要知道包含内含子的上游和下游序列,一样设计引物了。
2楼2006-04-02 23:27:01
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wiflash

我现在知道mRNA序列,我想知道内含子的序列,我现在主要是想看在外显子和内含子上有没有突变,因此也需要扩增内含子序列,我在NCBI上BLAST了,但是找不到,只有人的这个基因的全基因组序列,内含子的保守性很低,能不能通过人的去设计呢?
3楼2006-04-03 18:01:10
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wj_21cn

木虫 (正式写手)

可以试一下,只要不是衰到和引物配对的那段序列,正好不保守,就可以了。:)
4楼2006-04-03 18:32:24
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