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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】重金求助：模拟一个蛋白在不同环境中的构象
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匿名

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1楼2010-07-08 22:18:37
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tingjun

木虫 (小有名气)
★ ★
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lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-10 16:50:19
要是残基很多的话作动力学模拟不太好做啊！
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4楼2010-07-10 15:26:16
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caozx

银虫 (小有名气)
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-07-09 11:52:38
不同温度和不同pH下做过，但不同强度没做过。

我看了下PDB， 这个蛋白里面有一个金属离子。而且残基比较多。

可以考虑用能量优化或模拟退火的方法找到最适构象。
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2楼2010-07-09 09:56:21
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匿名

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3楼2010-07-09 11:03:32
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caozx

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
有什么别的比较好的办法吗？
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5楼2010-07-11 15:16:24
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