24小时热门版块排行榜    

查看: 3988  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wangtingyun

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS-sorption中力场编辑的一个基础问题 已有7人参与

如题,对Dreiding力场进行编辑。
主要是修改两项,一项是D0,一项是R0
通过看帮助文件,发现D0对应well-depth井深,应该是ε;而R0对应equilibrium distance,应该是σ。
问题是:文献中给出ε值时一般是以这样的形式给出的:ε/kB,其中kB是波尔兹曼常数。整体单位是K,一般ε/kB的值都有几十到几百。而在MS提供的D0,单位是kal/mol,其值却都只有零点几。
请问,这两者之间是如何转化的?还是我的理解有错?
我接触GCMC时间不长,还是新手。请高手们不吝赐教!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Himamy

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 郭同学 at 2018-06-05 10:44:28
请问一下,D0和那个参数的转化为什么除以500多的那个数??
...

http://www.mamicode.com/info-detail-2248529.html
8楼2022-03-29 20:31:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★
wangtingyun(金币+8):不说了,眼泪哗哗的!闷头搞了两天,不如版主几句话! 2010-07-06 17:10:38
lei0736(金币+5):谢谢 2010-07-09 16:56:55
MS的LJ12-6公式与一般情况下看到的LJ12-6公式不太一样。R0和σ也有转换关系,R0=2^(1/6)*σ,而D0和ε的转换关系应该是D0约为ε/kB/503.2,我们就拿Dreiding中的C_3来说,文献中一般给出的数据是,σ=3.47 A ε/kB=47.84 K,换算后就得到R0=3.895 A D0=47.84/503.2=0.09501=0.9501e-01 kcal/mol 和MS中Dreiding提供的力场结果R0=3.8983 A D0=0.9510e-01 kcal/mol 还是比较一致的吧。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2010-07-06 16:53:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xj200920075

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,能不能介绍下在ms中怎么修改力场啊
6楼2015-02-28 15:50:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

郭同学

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ghcacj at 2010-07-06 16:53:45
MS的LJ12-6公式与一般情况下看到的LJ12-6公式不太一样。R0和σ也有转换关系,R0=2^(1/6)*σ,而D0和ε的转换关系应该是D0约为ε/kB/503.2,我们就拿Dreiding中的C_3来说,文献中一般给出的数据是,σ=3.47 A ε/kB= ...

请问一下,D0和那个参数的转化为什么除以500多的那个数??

发自小木虫Android客户端
7楼2018-06-05 10:44:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 18:18 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 17:36 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +3 雨打竹帘 2026-08-30 4/200 2026-08-30 12:35 by 白大多亮
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 29号明天会评吗 +3 笨笨唐 2026-08-28 3/150 2026-08-30 09:29 by cww8181
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见