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jsjs2004

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何从基因组DNA预测microRNA? 已有1人参与

哪儿有microRNA的预测软件VMir下载??
或者有什么网站或者其它软件可以使用的??
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waltere

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也是刚从书上看到的介绍,具体怎么使用你自己研究研究吧
MirScan http://genes.mit.edu/mirscan/
它是较简单的预测程序,有一定的局限性,只能分析与50对线虫Pre-microRNA茎环结构同源的序列。

RNAfold    最常用的二级结构分析程序,可提交7000bp。

还有
Vienna RNA Package   www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/

The DINAMelt Server

Mfold-3.2                  www.bioinfo.rpi.edu/%7Ezukerm/export/
2楼2010-09-19 17:40:05
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