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greenking

木虫 (正式写手)

I'm goddy !

引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-07-01 10:30:39:
顺序错了
应该是:XPREP → XS → XP → XL → XP → XL

你现在XL一次后,XS的结果被抹掉了。所以你现在要重新XS,再XP……
记住每次XP后要存,用file命令

[ Last edited by hao_jian on 2010-7-1 at 10 ...

我在XP里原子指认完的时候,它自动退出指认窗口,我再用file命令的时候,它说是错误指令,请帮忙看下是什么原因!
让心儿自在飞翔
11楼2010-07-01 11:27:24
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hao_jian

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-01 15:03:59
greenking(金币+1):好的,谢谢!! 2010-07-01 20:40:50
引用回帖:
Originally posted by greenking at 2010-07-01 11:27:24:

我在XP里原子指认完的时候,它自动退出指认窗口,我再用file命令的时候,它说是错误指令,请帮忙看下是什么原因!

file后面给文件名,就是存出ins文件
12楼2010-07-01 13:08:55
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hao_jian

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-01 15:04:05
在1楼有个添加悬赏金的按钮,在每个回帖右下角有给金币的链接
13楼2010-07-01 13:12:28
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
帝夫(金币+3):感谢回帖交流! 2010-07-01 23:13:12
引用回帖:
Originally posted by greenking at 2010-07-01 11:20:05:

请问在XSHELL里面与在XP中看图与指认,有什么区别吗?
我在这一步没能确定给定原子和Q峰,对后面的XL有影响吗?

我解晶体的时候大多时候是用XSHELL的,因为我觉得方便一些,xp 里面你还要退出视图,然后输入命令,命名或者精修都不方便。XSHELL里面可以直接显示椭球结构,你可以拖动鼠标转动你的分子,命名的时候把鼠标放到一个原子或者Q峰上,然后按“S"键意思是select,就选中了,你可以选很多,然后点击labels,grouplabel...选择原子类型,然后OK。不想要的q峰,把鼠标放上去点击”k“ 意思是kill。命名完以后,删除所有q峰,点击refine,最好每次refine都选中anise~
就这样重复精修,就会解出来了。

不知道为什么上传不了图片~~希望对你有帮助
学无止境
14楼2010-07-01 23:08:39
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triiawypm

银虫 (正式写手)

★ ★
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-07-03 00:22:52
greenking(金币+2):谢谢!! 2010-07-03 21:54:55
引用回帖:
Originally posted by cluster8676 at 2010-07-01 23:08:39:


我解晶体的时候大多时候是用XSHELL的,因为我觉得方便一些,xp 里面你还要退出视图,然后输入命令,命名或者精修都不方便。XSHELL里面可以直接显示椭球结构,你可以拖动鼠标转动你的分子,命名的时候把鼠标放 ...

对,XSHELL定原子的时候很方便。
不过似乎这里面有的时候加氢会问题,以前我在给eta5配位的茂环加氢的时候就不行,可能是我没有开发出来真正的用法。所以加氢的时候我都是去XP里面输命令。有的时候感觉输命令很爽,就像感觉用DOS比windows爽一样,很多时候用太直观的东西不利人脑的发展,哈哈。

其实XP里也可以看椭球的,telp一下就行了,哈哈。不过要转就得proj,确实比XSHELL麻烦多了。另外,也可以去Hg里面看椭球。
15楼2010-07-03 00:12:24
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-07-03 04:23:22
引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-07-03 00:12:24:


对,XSHELL定原子的时候很方便。
不过似乎这里面有的时候加氢会问题,以前我在给eta5配位的茂环加氢的时候就不行,可能是我没有开发出来真正的用法。所以加氢的时候我都是去XP里面输命令。有的时候感 ...

恩,其实我加氢也是用xp的,因为xshell有时候会加错,不过可以到INS文件里面改。对于eta5配位的茂环加氢,你要先选择碳原子的杂化类型才能加对。我只是觉得xshell操作起来方便,对于刚入门的人,不用记那么多命令,学的快~
学无止境
16楼2010-07-03 01:29:50
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triiawypm

银虫 (正式写手)

★ ★
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-07-03 04:23:37
引用回帖:
Originally posted by cluster8676 at 2010-07-03 01:29:50:


恩,其实我加氢也是用xp的,因为xshell有时候会加错,不过可以到INS文件里面改。对于eta5配位的茂环加氢,你要先选择碳原子的杂化类型才能加对。我只是觉得xshell操作起来方便,对于刚入门的人,不用记那么多 ...

非配位的基茂环上面,如果没有氢的话,每个C上就是两个键了。
而配位的,则每个茂环上的C都与金属之间又有了一个键,所以如果把茂环的C设成SP2的话,那么三个键已经满了。如果设成SP3的话,那么加氢的位置也不会对。所以,我还是没搞清楚。
17楼2010-07-03 01:40:51
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-03 16:39:33
引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-07-03 01:40:51:


非配位的基茂环上面,如果没有氢的话,每个C上就是两个键了。
而配位的,则每个茂环上的C都与金属之间又有了一个键,所以如果把茂环的C设成SP2的话,那么三个键已经满了。如果设成SP3的话,那么加氢 ...

呵呵,没遇到过这种情况,我们一般只有苯环~
学无止境
18楼2010-07-03 01:52:23
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triiawypm

银虫 (正式写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-03 16:39:42
引用回帖:
Originally posted by cluster8676 at 2010-07-03 01:52:23:


呵呵,没遇到过这种情况,我们一般只有苯环~

哈哈,你好,我新开了一个帖子,欢迎参加讨论
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2189597
19楼2010-07-03 01:57:51
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