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triiawypm

银虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于空间群就高不就低。 已有5人参与

据说晶体解析,空间群的选择,就高不就低。
请教这句话的含意。

是不是一个晶体如果用两个空间群都能解出来,那么低空间群肯定是错误的?

我有一个晶体,用低空间群解出来结构较为合理,而用高的解出来,里面有很多原子温度因子很高。怎么回事

另有一个晶体,用p21/n解出了结构,但CHECK(网上和PLATON)检查的时候提示:Non-standard setting of Space-group P21/c...P21/n
这意味着正确的空间群应该是P21/c吗?

两者可有高低之分?
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crystalart

金虫 (小有名气)

★ ★
eeqeeq0002(金币+2):谢谢参与 2010-06-30 20:49:05
triiawypm(金币+3):好的,谢谢。 2010-06-30 23:58:31
晶体解析时低空间群容易解出来结构,但只有高空间群解析才合理;
P21/c、P21/n即使是发晶体学报这样专业的期刊也不用区分
在不断努力中艰难前行
2楼2010-06-30 13:09:12
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fly012345

木虫 (正式写手)

triiawypm(金币+2):感谢交流。 2010-06-30 23:58:43
P21/n是非标准的空间群符号试一试这个矩阵:1 0 0   0 -1 0  -1 0 -1
3楼2010-06-30 16:29:13
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linhua0402313

版主 (文坛精英)

★ ★
eeqeeq0002(金币+2):谢谢参与 2010-06-30 20:48:46
解析结构的过程中,对于空间群对称性比较高的晶体,往往直接用高的空间群解析比较有难度,所以降低空间群解析后再升高空间群,因为如果高的空间群是正确的,那么低的空间群往往又是高的子群,所以用低的空间群是可以解析的比较好的结果,但是用platon检测或者自己画图就可以明显知道空间群是不是有误了,所以空间群就高不就低,低了解析要仔细检查。
身在高山独抚琴,心随流水会知音
4楼2010-06-30 17:31:47
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linhua0402313

版主 (文坛精英)

triiawypm(金币+8):非常感谢耐心回答。希望能帮助我下面的问题。 2010-06-30 23:59:21
1.是不是一个晶体如果用两个空间群都能解出来,那么低空间群肯定是错误的?

解答:如果用两个空间群都能解析出来,而且是对的,那么低的空间群肯定不对(对于有心的空间群),如果是无心的空间群,还要看flack参数,一般用platon检查一下就知道了

2.我有一个晶体,用低空间群解出来结构较为合理,而用高的解出来,里面有很多原子温度因子很高。怎么回事?

解答:可以先用低的解析,再用platon升上去再重新解析一下
直接用高的解析出现温度因子高的原因可能是你的晶体质量的原因,不然也不用降低空间群解析,质量好的晶体用正确的高的空间群一般是可以解析的

3.另有一个晶体,用p21/n解出了结构,但CHECK(网上和PLATON)检查的时候提示:Non-standard setting of Space-group P21/c...P21/n
这意味着正确的空间群应该是P21/c吗?

解答:p21/n这个和p21/c是一样的空间群,只是前者不是标准的空间群,可以用platon装换一下再解析看看就可以了
身在高山独抚琴,心随流水会知音
5楼2010-06-30 17:39:54
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triiawypm

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by linhua0402313 at 2010-06-30 17:31:47:
解析结构的过程中,对于空间群对称性比较高的晶体,往往直接用高的空间群解析比较有难度,所以降低空间群解析后再升高空间群,因为如果高的空间群是正确的,那么低的空间群往往又是高的子群,所以用低的空间群是可 ...

我的晶体用P-1和P21/C都能解出结构
前者解出来是两个分子.温度因子正常.Rint也正常,小于0.1
后者是一个分子,但是里面有些原子温度因子高.Rint值0.23

问题是用P-1解完之后,用PLATON检查,并没有提示提升空间群.

不能提升,是不是仍然是P21/C正确呢?
6楼2010-06-30 19:08:40
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惟真惟实

铁杆木虫 (著名写手)

路过学习~~~
工作了~~
7楼2010-06-30 19:22:02
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