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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 【求助】鬼原子
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zhaoxia2501

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】鬼原子 已有3人参与

我想请问大家一个问题：我想做NMR计算，首先做了笼的计算，然后做衍生物的计算，可是在衍生物中加鬼原子时和笼中加鬼原子时的位置不一样，我想计算几何中心的NICS值，应该怎么把鬼原子加到准确的位置呢？



[ Last edited by zhaoxia2501 on 2010-6-28 at 10:13 ]
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1楼 2010-06-28 10:09:58
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流~！！！！ 2010-06-29 08:31:51
请问楼主NICS是什么啊？没用过鬼原子，请楼主指教，谢谢
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2楼2010-06-28 13:01:25
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zhaoxia2501

金虫 (小有名气)
★
heyo_123(金币+1):鼓励交流~！！！！ 2010-06-29 08:31:18
引用回帖:
Originally posted by ter20 at 2010-06-28 13:01:25:
请问楼主NICS是什么啊？没用过鬼原子，请楼主指教，谢谢

NICS：核独立化学位移（nucleus independent chemical shift）主要用来判断芳香性。在做单点能计算的时候加上关键词NMR即可。
鬼原子本版上有，ter20可以搜一下，鬼原子（Ghost atom）好像已经有人回答你的问题了！

[ Last edited by zhaoxia2501 on 2010-6-28 at 15:59 ]
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3楼2010-06-28 15:55:50
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ter20 at 2010-06-28 13:01:25:
请问楼主NICS是什么啊？没用过鬼原子，请楼主指教，谢谢

多谢啦，又学到了新东西
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4楼2010-06-28 16:52:29
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3867826

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zhaoxia2501 at 2010-06-28 15:55:50:

NICS：核独立化学位移（nucleus independent chemical shift）主要用来判断芳香性。在做单点能计算的时候加上关键词NMR即可。
鬼原子本版上有，ter20可以搜一下，鬼原子（Ghost atom）好像已经有人回答你的问题 ...

又学了点！！！
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拒稿，终于体会到了！乱写接受，认真写拒稿，这就是2和4的区别吗？
5楼2010-06-28 16:55:40
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xuyy2010

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by zhaoxia2501 at 2010-06-28 10:09:58:
我想请问大家一个问题：我想做NMR计算，首先做了笼的计算，然后做衍生物的计算，可是在衍生物中加鬼原子时和笼中加鬼原子时的位置不一样，我想计算几何中心的NICS值，应该怎么把鬼原子加到准确的位置呢？
[img]h ...

我想请教个问题：
(1).在计算NICS值时，对于对称性较低不规则的立体结构，鬼原子要如何放？


你好  我现在也遇到这样的情况  我的体系也是对称性很低   努力之下 只找到中点  但是怎么样才能在中点的正上方或者正下方添加鬼原子呢  请给予指点   谢谢
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6楼2011-05-17 20:04:13
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mchen10

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
问个笨问题，楼主你的体系看不出来有什么芳香性，为啥做NICS

做的话，可以做两个值，一个是以分子中心做的，一个是以笼中心做的，个人以为笼中心意义更大些
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更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
7楼2011-05-17 22:03:42
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
小红豆(金币+2): 感谢交流 2011-05-18 12:58:41
引用回帖:
Originally posted by zhaoxia2501 at 2010-06-28 10:09:58:
我想请问大家一个问题：我想做NMR计算，首先做了笼的计算，然后做衍生物的计算，可是在衍生物中加鬼原子时和笼中加鬼原子时的位置不一样，我想计算几何中心的NICS值，应该怎么把鬼原子加到准确的位置呢？
[img]h ...

不是很明白楼主的意思，但是我知道用chemcraft可以把鬼原子加到你所选择的原子的中心，很方便，不知道对楼主有没有帮助
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8楼2011-05-18 09:18:08
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