24小时热门版块排行榜    

查看: 840  |  回复: 0

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【讨论】GAMESS 中 ZMT 的对称性问题

最近正努力地学习 GAMESS,发现一个有关分子几何坐标的问题,即分子有对称性时,用 ZMT 形式输入结构时,发现很难满足 GAMESS 对对称性的要求。如果用 UNIQUE 或者 CART 坐标形式则相对容易一些。

比如甲烷的 TD 对称性,进行单点能计算时,用 UNIQUE 很好,但用 ZMT 则会出现错误,下面是输入文件:
CODE:
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=ENERGY COORD=UNIQUE $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
$DATA
Methane
TD

C     6.0    -0.00000     0.00000     0.00000
H     1.0     0.63133    -0.63133    -0.63133
$END

以下 ZMT 坐标是从上面的坐标中,用 MacMolPlt 转换过来的:
CODE:
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=ENERGY COORD=ZMT $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
$DATA
Methane
TD

C
H   1    1.09350
H   1    1.09350  2 109.4712
H   1    1.09350  2 109.4712  3  120.0000  0
H   1    1.09350  2 109.4712  3 -120.0000  0
$END

出错信息如下:
引用回帖:
ERROR!
YOUR CART/ZMT/ZMTMPC INPUT GENERATED   79 ATOMS,
BUT ONLY    5 ATOMS WERE PRESENT IN YOUR $DATA.
THIS MEANS THERE IS A MISTAKE IN YOUR COORDINATES,
OR YOUR CHOICE OF GROUP.   ADIOS, MY FRIEND!!

AFTER PRINCIPAL AXIS TRANSFORMATION, THE PROGRAM
HAS CHOSEN THE FOLLOWING ATOMS AS BEING UNIQUE:
C           6.0   -0.0000000700    0.0000000000    0.0000000000
H           1.0    1.0934999300    0.0000000000    0.0000000000
H           1.0   -0.3644996987    0.0000000000    1.0309618182
H           1.0   -0.3644996987   -0.8928391249   -0.5154809091
H           1.0   -0.3644996987    0.8928391249   -0.5154809091
EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Mon Jun 28 09:49:24 2010

请问如何才能构建一个基于 ZMT 坐标的 TD 构型的甲烷的输入文件?

非常感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 snoopyzhao 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +10 Isak0320 2026-10-12 14/700 2026-10-14 11:39 by thegarfield
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+3 David1982 2026-10-13 6/300 2026-10-14 11:14 by 北京莱茵编辑
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 12/600 2026-10-13 20:40 by Merryya
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见