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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【讨论】GAMESS 中 ZMT 的对称性问题

最近正努力地学习 GAMESS,发现一个有关分子几何坐标的问题,即分子有对称性时,用 ZMT 形式输入结构时,发现很难满足 GAMESS 对对称性的要求。如果用 UNIQUE 或者 CART 坐标形式则相对容易一些。

比如甲烷的 TD 对称性,进行单点能计算时,用 UNIQUE 很好,但用 ZMT 则会出现错误,下面是输入文件:
CODE:
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=ENERGY COORD=UNIQUE $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
$DATA
Methane
TD

C     6.0    -0.00000     0.00000     0.00000
H     1.0     0.63133    -0.63133    -0.63133
$END

以下 ZMT 坐标是从上面的坐标中,用 MacMolPlt 转换过来的:
CODE:
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=ENERGY COORD=ZMT $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
$DATA
Methane
TD

C
H   1    1.09350
H   1    1.09350  2 109.4712
H   1    1.09350  2 109.4712  3  120.0000  0
H   1    1.09350  2 109.4712  3 -120.0000  0
$END

出错信息如下:
引用回帖:
ERROR!
YOUR CART/ZMT/ZMTMPC INPUT GENERATED   79 ATOMS,
BUT ONLY    5 ATOMS WERE PRESENT IN YOUR $DATA.
THIS MEANS THERE IS A MISTAKE IN YOUR COORDINATES,
OR YOUR CHOICE OF GROUP.   ADIOS, MY FRIEND!!

AFTER PRINCIPAL AXIS TRANSFORMATION, THE PROGRAM
HAS CHOSEN THE FOLLOWING ATOMS AS BEING UNIQUE:
C           6.0   -0.0000000700    0.0000000000    0.0000000000
H           1.0    1.0934999300    0.0000000000    0.0000000000
H           1.0   -0.3644996987    0.0000000000    1.0309618182
H           1.0   -0.3644996987   -0.8928391249   -0.5154809091
H           1.0   -0.3644996987    0.8928391249   -0.5154809091
EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Mon Jun 28 09:49:24 2010

请问如何才能构建一个基于 ZMT 坐标的 TD 构型的甲烷的输入文件?

非常感谢!
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