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wdy0330

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】基因拷贝数的概念 已有6人参与

在最近的实验中忽然对“基因拷贝数”这个概念有点模糊起来。

以人类基因组为例,我们讲A基因在人类基因组中存在两个拷贝,那意思是说在一套人类基因组中有两个这样的基因,就是所说的等位基因,且位于一对染色体上,不知我这样的理解是否正确?

假如B基因在人类基因组中存在10个拷贝,那意思是说在一套人类基因组中有10个这样的基因,并且是分别位于一对染色体上,就是说在一个DNA链条上存在该基因重复且重复5次,不知我这样的理解是否正确?

我们在实验中采用定量PCR检测C基因在人类基因组中的拷贝数,那检测所得结果的单位该如何定义呢?是定义为N拷贝/每单位样品,还是定义为N拷贝/套基因组?貌似感觉两种方法都不是十分科学!
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jinyi0921

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同问啊!请各位高手指点!
9楼2013-12-24 21:48:03
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-06-24 17:57:38
关于10拷贝的理解错误,每一对都可以位于不同的染色体上
基于PCR法检测拷贝数的结果其实并不可靠,应该采用southern,多用几组酶来确定
southern经典、笨、麻烦,但是可靠
2楼2010-06-24 17:39:37
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wdy0330

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-06-24 17:39:37:
关于10拷贝的理解错误,每一对都可以位于不同的染色体上
基于PCR法检测拷贝数的结果其实并不可靠,应该采用southern,多用几组酶来确定
southern经典、笨、麻烦,但是可靠

Southern杂交确实经典,但是若A基因在一套人类基因组中仅存在两个拷贝,他们存在于一对染色体的相同位置上,那采用Southern恐怕仅能检测出一条带吧?这也无法证明是存在两个拷贝?

此外麻烦你我们在定量中,检测所得结果的单位该如何定义呢?是定义为N拷贝/每单位样品,还是定义为N拷贝/套基因组?貌似感觉两种方法都不是十分科学!
3楼2010-06-25 09:16:23
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流 2010-06-25 23:07:54
引用回帖:
Originally posted by wdy0330 at 2010-06-25 09:16:23:




Southern杂交确实经典,但是若A基因在一套人类基因组中仅存在两个拷贝,他们存在于一对染色体的相同位置上,那采用Southern恐怕仅能检测出一条带吧?这也无法证明是存在两个拷贝?

此外麻烦你我们在定 ...

==b本来就有等位基因的说法,一就代表二了,这是野生型、常染色体的情况
性染色体另当别论
当然你为了证明有染色体异变之类的,你可以用基于PCR的多态检测手段来做

而至于结果的表述,你还是看看文献吧,我不做这一块,我只能说这个技术可以解决这个问题
4楼2010-06-25 15:35:07
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