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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】基因拷贝数的概念
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wdy0330

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】基因拷贝数的概念 已有6人参与

在最近的实验中忽然对“基因拷贝数”这个概念有点模糊起来。

以人类基因组为例，我们讲A基因在人类基因组中存在两个拷贝，那意思是说在一套人类基因组中有两个这样的基因，就是所说的等位基因，且位于一对染色体上，不知我这样的理解是否正确？

假如B基因在人类基因组中存在10个拷贝，那意思是说在一套人类基因组中有10个这样的基因，并且是分别位于一对染色体上，就是说在一个DNA链条上存在该基因重复且重复5次，不知我这样的理解是否正确？

我们在实验中采用定量PCR检测C基因在人类基因组中的拷贝数，那检测所得结果的单位该如何定义呢？是定义为N拷贝/每单位样品，还是定义为N拷贝/套基因组？貌似感觉两种方法都不是十分科学！
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1楼 2010-06-24 16:40:45
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流 2010-06-25 23:07:54
引用回帖:
Originally posted by wdy0330 at 2010-06-25 09:16:23:




Southern杂交确实经典，但是若A基因在一套人类基因组中仅存在两个拷贝，他们存在于一对染色体的相同位置上，那采用Southern恐怕仅能检测出一条带吧？这也无法证明是存在两个拷贝？

此外麻烦你我们在定 ...

==b本来就有等位基因的说法，一就代表二了，这是野生型、常染色体的情况
性染色体另当别论
当然你为了证明有染色体异变之类的，你可以用基于PCR的多态检测手段来做

而至于结果的表述，你还是看看文献吧，我不做这一块，我只能说这个技术可以解决这个问题
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4楼2010-06-25 15:35:07
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-06-24 17:57:38
关于10拷贝的理解错误，每一对都可以位于不同的染色体上
基于PCR法检测拷贝数的结果其实并不可靠，应该采用southern，多用几组酶来确定
southern经典、笨、麻烦，但是可靠
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2楼2010-06-24 17:39:37
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wdy0330

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-06-24 17:39:37:
关于10拷贝的理解错误，每一对都可以位于不同的染色体上
基于PCR法检测拷贝数的结果其实并不可靠，应该采用southern，多用几组酶来确定
southern经典、笨、麻烦，但是可靠

Southern杂交确实经典，但是若A基因在一套人类基因组中仅存在两个拷贝，他们存在于一对染色体的相同位置上，那采用Southern恐怕仅能检测出一条带吧？这也无法证明是存在两个拷贝？

此外麻烦你我们在定量中，检测所得结果的单位该如何定义呢？是定义为N拷贝/每单位样品，还是定义为N拷贝/套基因组？貌似感觉两种方法都不是十分科学！
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3楼2010-06-25 09:16:23
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漆腥瞅宠

禁虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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5楼2010-06-26 15:04:20
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