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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【讨论】MS中sorption模块的MC计算
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-25 11:22:19
是吗？那我不太清楚，毕竟很久没做了，问题是你计算的结果和别人差距有多大，这个是关键，我记得Sorption计算的结果偏小
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11楼2010-06-24 17:25:34
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rdw00

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-06-24 17:25:34:
是吗？那我不太清楚，毕竟很久没做了，问题是你计算的结果和别人差距有多大，这个是关键，我记得Sorption计算的结果偏小

文献数据在1.3%（h2分子数为41个，我的1.1%分子数34个左右）
你还有关于Buch和Cracknell的文献吗？！
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12楼2010-06-24 17:32:08
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xuechunyu

银虫 (小有名气)
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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-25 08:08:52
呵呵，不会啊，我计算的MOF-5的结果都很类似的啊！
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古之君子,其责己也重以周,其待人也轻以约，今之君子则不然。其责人也详,其待己也廉
13楼2010-06-24 18:12:20
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rdw00

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by xuechunyu at 2010-06-24 18:12:20:
呵呵，不会啊，我计算的MOF-5的结果都很类似的啊！

你是用什么计算的？
能把你的力场参数发一份吗？
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14楼2010-06-24 18:15:41
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

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lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-25 11:22:38
引用回帖:
Originally posted by rdw00 at 2010-06-24 17:32:08:


文献数据在1.3%（h2分子数为41个，我的1.1%分子数34个左右）
你还有关于Buch和Cracknell的文献吗？！

这个结果也正常，我记得以前做过甲烷的MOF-5吸附，3MPa下，我计算的是61个分子，文献上有66个的，有76个的。
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15楼2010-06-25 09:00:16
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zyj8119

木虫 (著名写手)
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-25 13:43:37
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Originally posted by rdw00 at 2010-06-24 17:22:03:


我吸附的时候用的文献给的参数，描述了H2中的H的相关力场参数。
forcite选择优化几何结构优化的时候，有个more选项，里面有个optimize cell 这个选项，勾上就可以优化晶胞参数

干吗要优化晶胞呢？你又不是自己建立的晶胞，是衍射得到的数据，没有必要优化晶胞。
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好好学习，天天向上。
16楼2010-06-25 11:46:53
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rdw00

木虫 (著名写手)
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Originally posted by zyj8119 at 2010-06-25 11:46:53:

干吗要优化晶胞呢？你又不是自己建立的晶胞，是衍射得到的数据，没有必要优化晶胞。

直接用衍射得到的结构参数数据吗？
但是算出来的MOF-5这个最基本的都不吻合啊。郁闷啊
你能不能教教我是怎么算的吗？
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17楼2010-06-25 12:50:26
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ghcacj

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阿超

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lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-25 17:23:42
引用回帖:
Originally posted by rdw00 at 2010-06-25 12:50:26:


直接用衍射得到的结构参数数据吗？
但是算出来的MOF-5这个最基本的都不吻合啊。郁闷啊
你能不能教教我是怎么算的吗？

对，一般来说就是直接用衍射得到的数据，晶胞参数别乱动。吸附结果不吻合，从GCMC上找原因，还有，sorption用的LJ12-6公式和一般文献上的12-6公式不一样，你仔细看看帮助文件。
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18楼2010-06-25 16:51:05
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rdw00

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-06-25 16:51:05:

对，一般来说就是直接用衍射得到的数据，晶胞参数别乱动。吸附结果不吻合，从GCMC上找原因，还有，sorption用的LJ12-6公式和一般文献上的12-6公式不一样，你仔细看看帮助文件。

好的，谢谢
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19楼2010-06-26 09:32:58
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gtolv8688

铜虫 (小有名气)
★
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这么说来对于吸附剂是否还要做优化了呢？我从CCDC里下载的MOF-9的结构十分乱，而且没有键，只有原子，不知道要如何删除多余原子并做优化啊，从另一篇文献后的supporting information中直接下载到了另一种MOF-18的cif文件，与文献对比并不多余原子，这样是否让需要做优化？期待回答啊~
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-06-25 16:51:05:

对，一般来说就是直接用衍射得到的数据，晶胞参数别乱动。吸附结果不吻合，从GCMC上找原因，还有，sorption用的LJ12-6公式和一般文献上的12-6公式不一样，你仔细看看帮助文件。

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Livewithproblem！
20楼2010-09-15 15:53:45
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