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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助完结】提高CDOCKER结果的能量值
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CADD

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助完结】提高CDOCKER结果的能量值 已有4人参与

做过CDOCKER后，-DOCKER_ENERGY的值一直不是很好，但是晶体结构的对接结果却和原来很相近，RMSD的值是0.8左右，这样的结果可以接受吗？

[ Last edited by CADD on 2010-6-25 at 17:21 ]
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1楼 2010-06-23 20:34:23
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张军帅

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-24 10:27:40
个人觉得可以，因为对接不能只看能量值的
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人生若只如初见
2楼2010-06-23 20:58:27
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nh13

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-24 10:27:46
可以换其他对接工具试试，还有在线的，可能效果会好些。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-06-23 23:13:59
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CADD

银虫 (正式写手)
谢谢，不好意思，昨天比较急，忘了附加金币了。下次一定补上。太感谢了。
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4楼2010-06-24 08:51:21
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see_uok

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我遇到个问题  就是，-cdocker_energy为负值，也就是对接能量为正值
技术说可以优化后再做对接 可是优化后没有什么变化。。。。。
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5楼2011-07-25 10:15:18
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
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故地如重游月圆更寂寞
6楼2011-09-05 19:02:22
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