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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 文献解析 » 【求助】空间群与文献中的不一样，怎么办？
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】空间群与文献中的不一样，怎么办？ 已有9人参与

做了一个文献中有报道的晶体，一查文献结果发现晶体数据不一样，详见下面：
文献中：1.Reference: A.Waskowska, J.Kroupa (1995) Acta Crystallogr.,Sect.C(Cr.Str.Comm.),51,420
Formula: C8 H20 N1+,H2O4P1-
Compound Name: n-Octylammonium dihydrogenphosphate
Space Group: P21/c Cell: a 4.589(2) b 34.701(7) c 7.365(3)
Space Group No.: 14 (Å,°) α =90.00 β =90.61(3) γ =90.00
R-Factor (%): 6.5 Temperature(K): 295 Density(g/cm3): 1.287
2.Reference: J.Fabry, V.Petricek, I.Cisarova, J.Kroupa (1997)
Acta Crystallogr.,Sect.B(Str.Sci.),53,272
Formula: C8 H20 N1+,H2O4P1-
Compound Name: n-Octylammonium dihydrogen phosphate
Space Group: P21/n Cell: a 9.163(1) b 34.677(4) c 7.361(7)
Space Group No.: 14 (Å,°) α=90°   β= 90.81(1)°   γ = 90°
R-Factor (%): 3.33 Temperature(K): 295 Density(g/cm3): 1.291
3.Reference: S.R.J.Oliver, A.J.Lough, G.A.Ozin (1998) Inorg.Chem.,37,5021
Formula: C8 H20 N1+,H2O4P1-
Compound Name: n-Octylammonium dihydrogen phosphate
Space Group: P21/c Cell: a 4.554 b 34.652(3) c 7.328(1)
Space Group No.: 14 (Å,°) α=90°   β= 90.66°   γ = 90°
R-Factor (%): 4.74 Temperature(K): 173 Density(g/cm3): 1.305
我得到的数据：
Crystal system        Orthorhombic
Space group        Pbcn
Unit cell dimensions        a=7.3810(8) Å  b=9.1761(10) Å c=34.770(3) Å  α =90°   β= 90°   γ = 90°Volume        2354.9(4) Å3Z=8 Calculated density 1.282 g/cm3
T=298

我的数据check cif的时候也没有说空间群有错误，现在不知道怎么办了，文章中肯定要对比一下文献中的数据，我也不找到怎么说了，还请高手指点一下，看看问题怎样解决？谢谢！

[ Last edited by 文言文 on 2010-6-23 at 08:09 ]
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1楼 2010-06-22 21:32:26
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ren1128 at 2010-06-23 08:45:23:
R值很有点大啊，这个东西是一样的，文献的单胞参数也是由于晶体衍射数据不好造成的，应该说这个晶体是正交的而不是单斜的。


我们的老师在精修的时候说由于O3和O4的环境是一样的，也不知道是把哪个O上的氢脱掉了，因此在精修的时候把这两个原子上面H的改为占有率0.5，您说这样处理对吗？另外在写文章的时候是不是也要说明一下，因为做出来的分子结构图表面还是阴离子H3PO4，谢谢！
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8楼2010-06-23 09:00:36
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gxsddxj

木虫 (正式写手)
文言文(金币+2):好像空间群不一样啊？ 2010-06-23 08:11:47
yanhualover:谢谢交流 2010-06-23 08:22:35
我们认为你上面提到的一三是完全一样的 你得到的和第二种是一样的
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莹儿认识你们是缘分.让我们共同提高
2楼2010-06-22 21:40:34
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
文言文(金币+2):谢谢参与，R值见回帖！ 2010-06-23 08:13:41
yanhualover:谢谢交流 2010-06-23 08:22:27
你最后的R是多少?
你最好用diamond画出来看看是不是一样。你的和文献里的第二种应该是一样的，只是对称度提高了
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3楼2010-06-22 22:41:17
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by rain841230 at 2010-06-22 22:41:17:
你最后的R是多少?
你最好用diamond画出来看看是不是一样。你的和文献里的第二种应该是一样的，只是对称度提高了

这是我的R值：
     Final R indices [I>2sigma(I)]     R1 = 0.0809, wR2 = 0.1742
  
      R indices (all data)              R1 = 0.1405, wR2 = 0.2110
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4楼2010-06-23 08:14:09
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