应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请教MS周期箱中初始模型进行压缩处理
51/1返回列表
查看: 938  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

liuxianlv

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教MS周期箱中初始模型进行压缩处理 已有3人参与

　读文献遇到困惑，请教一下各位大侠，谢谢！
“MD模拟
在compass力场下,取NVT系综,对纯TATB晶体进行MD模拟,时间步长1 fs,模拟8 ×104步,体系达到平衡后,密度为1. 94 g/ cm3. 再模拟8 ×104步保存轨迹,最后进行静态力学分析. 对图1所示周期箱中的PBX初始模型进行压缩处理,直到接近理论密度(1. 81 g/ cm3 ) ;然后进行NVT系综下的MD模拟,与纯TATB类似,以8 ×104步求得PBX平衡构型(见图2). 再模拟8 ×104步保存轨迹,最后进行静态力学分析.”
对这段话，我有以下不解：

  1。 体系达到平衡后,密度为1. 94 g/ cm3，这个密度怎么得来的，输出文件会有吗？
2。对图1所示周期箱中的PBX初始模型进行压缩处理,直到接近理论密度(1. 81 g/ cm3 )，这个怎么进行压缩处理，怎么设置？压缩后在哪儿看的到密度是接近1. 81 g/ cm3。
3。静态力学分析是怎么分析的啊？是用discover的那个analysis吗？
  谢谢各位了！本实验室没有师兄师姐教自己瞎整，是很困难啊
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-06-22 20:49:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！鼓励发有价值的话题！ 2010-06-22 22:21:36
liuxianlv(金币+3):谢谢指点 2010-07-02 16:06:36
谈一下个人的理解，不对请指正
1、MS在preperty一栏中可以显示密度，所以第一个问题很好解决，具体在那个文件中还没有具体找过
2、直接压缩应该不是的，可能是根据高压实验获得的晶格参数来获得相应的压缩后的密度，这个自己在MS中重新建晶体模型就行
3、这个问题没看过，不太清楚，期待高手出现
赞一下(1人) 回复此楼
博学、审问、慎思、明辨、笃学
3楼2010-06-22 20:59:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

condensed

木虫 (著名写手)
★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！鼓励发有价值的话题！ 2010-06-22 22:21:12
liuxianlv(金币+2):xiexie指点 2010-07-02 16:06:21
密度算出来的吧...M/V.
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-06-22 20:52:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

euygnay

铁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
想问楼主问题解决了么？我也碰到相同的问题了，如何压缩晶体达到确定的密度？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2019-04-13 17:33:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:34 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:18 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-28 23:19 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:45 by ez6fGg9abYaj
[有机交流] 同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？ +3 tianxiaoxian 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:44 by tianxiaoxian
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:28 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-28 22:21 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 17:30 by ZYXdhzDAy9ZX
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +7 zju2000 2026-09-26 8/400 2026-09-28 16:42 by beefly
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 15:32 by ZYXdhzDAy9ZX
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭