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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】向bay__gulf求助！！
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雪扬0613

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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981993楼: Originally posted by bay__gulf at 2010-06-26 10:36:53:
理解很正确


为使程序好理解, 修改了点数据
water and name OH2 and z < 7.6 and z > -7.6
这是整个管子中的水
改变z 的上下限, 可以求得一小段区域中, 水的平均偶极方向
多做几个位置, 可以求得 ...

想知道如果想求legendre 2nd order polynomial随Z轴变化的时候应该如何编程？
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11楼2012-03-15 21:34:02
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-16 08:58:22
引用回帖:
1176034楼: Originally posted by 雪扬0613 at 2012-03-15 21:34:02:
想知道如果想求legendre 2nd order polynomial随Z轴变化的时候应该如何编程？

把z轴分成若干小的bin, 然后分段统计就可以了
bin 的大小应合适, 不宜太大,曲线细节不清楚, 也不宜太小,曲线噪音就太大了
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12楼2012-03-16 08:45:31
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雪扬0613

新虫 (初入文坛)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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1176040楼: Originally posted by bay__gulf at 2012-03-16 08:45:31:
把z轴分成若干小的bin, 然后分段统计就可以了
bin 的大小应合适, 不宜太大,曲线细节不清楚, 也不宜太小,曲线噪音就太大了

谢谢了，也就是将bin的长度稍微大于偶极矩的模长度就可以了，是这么理解的吧
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13楼2012-03-16 10:34:15
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雪扬0613

新虫 (初入文坛)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
961874楼: Originally posted by bay__gulf at 2010-06-25 16:34:06:
请问vecadd、vecscale、vecsub、veclength这些命令在哪里可以学习一下？根本不知道它们的用途？请给一个关于这类命令的全面的学习资料！！！十分感谢！
====
vmd ug 的第10章讲的是Vectors and Matrices
这个u ...

lindex $vecd 2 这个指的不是y分量吗？为什么是Z分量呢
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14楼2012-03-16 11:12:49
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雪扬0613

新虫 (初入文坛)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1176034楼: Originally posted by 雪扬0613 at 2012-03-15 21:34:02:
想知道如果想求legendre 2nd order polynomial随Z轴变化的时候应该如何编程？

按照你编的程序算了一下，为什么我得到的结果是主体相的Legendre值为-0.5，按常理说它不应该是均相的，等于0的吗
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15楼2012-03-16 17:41:27
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雪扬0613

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
对上面的小程序修改了一下，我觉得应该是先求costheta的平方再平均，而不是先求角度的平均。给bay_gulf敬个礼，谢谢
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16楼2012-03-17 16:35:49
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