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kevinding

至尊木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】哪位能帮忙写一下DS中小分子和蛋白对接的方法啊?计算一下能量什么的?非常感 已有8人参与

哪位能帮忙写一下DS中小分子和蛋白对接的方法啊?计算一下能量什么的?非常感谢!
我现在就能导入蛋白和小分子结构 怎么连接一直不会弄 哪位能指导一下 非常感谢!!!
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淘佩塔

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
947862楼: Originally posted by tingjun at 2010-06-25 09:57:19
DS中的小分子受体对接有4种,LibDock和LigandFit是半柔性对接,而CDOCKER和flexible docking是柔性对接,要看具体的体系

你好~想问你个问题啊,我用时的flexible docking,对接之后又score和pose,我按从高到低的顺序进行排列,之后跑了MM-PBSA,发现有些分低的复合体的结合自由能反而低一些,有的score是负值,但算完MM-PBSA之后的结合自由能反而是负值,而且很小,是我计算的过程有问题吗?不是score越高结合的越好,结合自由能越低吗(一般为负值)?我的理解有问题吗?
13楼2013-01-12 11:08:20
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
kevinding(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-22 20:17:56
按照帮助手册上的操作即可,没有什么难度。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
2楼2010-06-20 15:21:17
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kevinding

至尊木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2010-06-20 15:21:17:
按照帮助手册上的操作即可,没有什么难度。

这个我肯定看了啊
就是不知道是什么情况 总用不起来 所以想哪位能帮忙写个简单的操作步骤
3楼2010-06-20 15:23:49
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-20 20:19:27
论坛中搜索一下,有个DS对接的教程下载,看看就知道了,都是傻瓜操作。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-06-20 18:48:57
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