| 查看: 537 | 回复: 2 | |||
amo11000金虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助/交流】有谁有查找蛋白质序列的氨基酸重复的软件或能帮忙设计一个这样的软件？ 已有2人参与
|
|
有三条FASTA格式的蛋白质序列， >sp|Q8JIV9|AGGA1_AGKAC Agglucetin subunit alpha-1 OS=Agkistrodon acutus PE=1 SV=1 MGRFIFVSFGLLLLLLVVFLSLSGTGADVDCLPGWSAYDQSCYRVFKLLKTWDDAEKFCTERPK GGHLVSIESAGERDFVAQLVSENKQTDNVWLGLKIQSKGQQCSTEWTDGSSVSYENFSEY QSKKCFVLEKNTGFRTWLNLNCGSEYAFVCKSPPRTRTRTRTRT >sp|Q8AYA5|AGGA2_AGKAC Agglucetin subunit alpha-2 OS=Agkistrodon acutus PE=1 SV=1 MGRFIFVSFGLLVVFLSLSGTGADFNCPPGWSAYDQYCYQVIKEPKNWDDAERFCTEQAD GGHLVSIESKGERDFVAQLVSQNIESVEDHVWTGLRVQNKEKQCSTEWSDGSSVSYENLL ELYMRKCGALERETGFHKWINLGCIQLNPFVCKFPPQCPPQCPPQCPPQC >sp|Q9I841|AGGA_AGKRH Rhodocytin subunit alpha OS=Agkistrodon rhodostoma PE=1 SV=1 GLEDCDFGWSPYDQHCYQGLEGLEGLEGLEAFNEQKTWDEAEKFCRAQENGAHLASIESNGEADFVSWLISQKDELADEDYVWIGLRAQNKEQQCSSEWSDGSSVSYENLIDLHTKKCGALEKLTGFRKWVN YYCEQMHAFVCKLLPY 现想查找其中氨基酸重复，例如LLLLLL, LVCLVCLVC，一共有20种氨基酸，所有这一类的串联的重复都要被找到，请问谁能帮忙设计一个这样的软件。 |
回复此楼» 猜你喜欢
科研求助
已经有4人回复
-
博士去二本高校当辅导员，如何调整心态？
已经有11人回复
-
面上有专家说实验设备不是我们单位的
已经有6人回复
-
江苏省自然基金 什么时候出结果
已经有6人回复
-
广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！
已经有11人回复
-
闲聊
已经有3人回复
-
两块石头
已经有10人回复
-
初秋的晨风
已经有6人回复
-
Ei源刊怎么投
已经有4人回复
2楼2010-06-21 11:53:52
amo11000
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2431.2
- 散金: 35
- 红花: 1
- 帖子: 257
- 在线: 292小时
- 虫号: 531672
- 注册: 2008-03-23
- 专业: 生物信息学
3楼2010-06-24 09:34:17