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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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cenwanglai

新虫

老和山猥琐派九段

[交流] 【求助成功】Au表面O原子扩散过度态的计算应该固定多少个原子呢? 已有5人参与

我用一个O原子在6层Au原子层表面上吸附的模型来算O的迁移能垒.方法(C)NEB.
请问:

(1)该怎么设置固定原子呢?比如固定下面第2-第6五层Au原子,甚至所有Au原子?

(2)这对提高收敛速度是不是有很大帮助呢?

(3)vststool中有这个功能的命令吗?

金币发完了,呵呵.谢谢各位回复,还有围观的人们.

[ Last edited by cenwanglai on 2010-6-21 at 14:45 ]
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zzy870720z

新虫

cenwanglai(金币+2):呵呵,谢谢! 2010-06-17 18:46:52
偶没做过表面计算
如果做结构驰豫的话上面应该多放几层吧
一般是三层吧,不太清楚那个需要固定几层
算是帮你顶贴了
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-06-17 18:42:52
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cenwanglai

新虫

老和山猥琐派九段

自己来一下吧,呵呵.总不能固定所考察的移动原子外所有其它原子吧?
3楼2010-06-18 08:41:29
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gump_813276

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


zzy870720z(金币+1):感谢交流 2010-06-18 11:24:01
cenwanglai(金币+5):呵呵,谢谢! 2010-06-18 15:35:09
可以的 在你的另个帖子里说了
只动O原子的话收敛会很快的 因为slab没有concerted movement势能面很简单
4楼2010-06-18 10:55:56
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shuikuliu

专家顾问

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cenwanglai(金币+3):谢谢你的分享,我多学习,呵呵! 2010-06-21 12:35:11
我看文献说,小分子的吸附对表面重构现象影响甚微,应该在吸附小分子时,固定所有的表面原子是可以的。当然,如果计算条件好的话,也可以不固定上面几层试一下
闭门造车对搞科研是要不得的,虫友们多多交流啊
5楼2010-06-21 12:27:24
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stractor

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

cenwanglai(金币+2):呵呵,谢谢回复 2010-06-21 14:43:59
固定原子就是采用selective dynamics 这个字,在POSCAR设置。固定一些原子不动当然运算速率加快了。
6楼2010-06-21 14:11:32
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