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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】如何减少计算时间
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匿名

用户注销 (正式写手)

外星球文坛精英
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1楼 2010-06-15 10:05:29
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sphaeroides

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by coolrainbow at 2010-06-20 09:27:28:


曾经看到一个说法，来源忘记了，说是在g03里面，内存如果比计算正好所需要的内存要大很多的话，则计算速度反而会下降。

另外，MP2你可以显调用direct等等方法来改善IO试试，同时注意MP2计算非常耗磁盘，要 ...

如果集群的内存大的话，磁盘文件暂存可以设为/dev/shm，即直接写内存。。。
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21楼2010-07-01 04:00:49
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2008从容

金虫 (小有名气)
同问，请大侠指点
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2楼2010-06-15 10:44:22
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
gjin101(金币+1):%nprocshared=4 %nproclinda=单机 %mem=4000MB，该怎样呢 2010-06-15 15:14:41
gjin101(金币+1):MP2(6-31g(d,p)),过渡金属用赝势，电荷+1，多重2， 2010-06-15 15:18:10
heyo_123(金币+1):是牛人，非神！ 2010-06-16 17:33:08
体系、方法、基组、基函数的数量、计算资源（%nprocshared=?  %nproclinda=?  %mem=?  maxdisk=?），一个都没说……除非是神，没人能回答

有人说世界上本没有神。凡人一旦做到了凡人不能做到的事情，那么他就成了神。However，这个版上都是凡人……

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-15 at 12:28 ]
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3楼2010-06-15 12:27:15
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
heyo_123(金币+1): 2010-06-17 21:24:50
gjin101(金币+1):那么同样基组，DFT优化会快很多吗 2010-06-17 23:48:06
这么大小的体系，mp2如果做优化，2-3天再正常不过了，如果算频率，一个星期也未必。如果单点算，2-3天那就有问题了。
用DFT当然要快很多了。优化一天一个差不多没问题——当然，你的初始结构也很重要，但相同情况下，DFT比mp2快几倍是不成问题的。所以一般科研中，你这样的体系，都是DFT优化的，如果为了得到更精确的能量数据，可以在DFT优化结构的基础上，做一个单点算就可以了，发3.0左右的文章在数据上是可以过关的了。

[ Last edited by zhangmt on 2010-6-18 at 01:19 ]
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-06-17 20:54:55
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