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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【求助】关于shelx加氢的问题
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
继续求助！！
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11楼2010-06-15 17:08:51
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
12楼2010-06-16 16:20:50
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ren1128

禁虫 (正式写手)
★
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13楼2010-06-17 13:15:18
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hao_jian

木虫 (正式写手)

把这个存成ins文件再修几轮

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rain841230(金币+3):谢谢相助！ 2010-06-17 12:40:58
把这个存成ins文件再修几轮

TITL jzjun10a in Pnma
CELL 0.71073  13.2903   7.5220  15.0990  90.000  90.000  90.000
ZERR    4.00   0.0027   0.0015   0.0030   0.000   0.000   0.000
LATT  1
SYMM 0.5-X, -Y, 0.5+Z
SYMM -X, 0.5+Y, -Z
SYMM 0.5+X, 0.5-Y, 0.5-Z
SFAC N H GA I
UNIT 28 84 4 12

L.S. 4
dfix 0.91 n1 h1a n1 h1b n4 h4a n4 h4b
dfix 1.49 h1a h1b h4a h4b
sadi n1 h1a n1 h1b
sadi n4 h4a n4 h4b
BOND
FMAP 2
PLAN 20

TEMP -170
LIST 3
WGHT    0.100000
FVAR       0.17769
I1    4    0.386071    0.250000    0.452813    10.50000    0.01200    0.01287 =
         0.01268    0.00000   -0.00027    0.00000
I2    4    0.061739    0.250000    0.362806    10.50000    0.01283    0.01714 =
         0.01447    0.00000    0.00211    0.00000
I3    4    0.164740    0.250000   -0.263670    10.50000    0.02258    0.01410 =
         0.01323    0.00000    0.00029    0.00000
GA4   3    0.226306    0.250000    0.097217    10.50000    0.00988    0.00931 =
         0.00810    0.00000    0.00072    0.00000
N1    1    0.298827    0.250000    0.219022    10.50000    0.01645    0.01475 =
         0.00927    0.00000   -0.00287    0.00000
H1A   2    0.268844    0.330358    0.255534    11.00000   -1.50000
H1B   2    0.364598    0.250000    0.211363    10.50000   -1.50000
N2    1    0.321023    0.056802    0.047131    11.00000    0.01587    0.01676 =
         0.01844   -0.00513   -0.00095    0.00063
AFIX  33
H2A   2    0.296012   -0.052637    0.060371    11.00000   -1.50000
H2B   2    0.383185    0.068988    0.071660    11.00000   -1.50000
H2C   2    0.325590    0.068958   -0.012698    11.00000   -1.50000
AFIX   0
N3    1    0.130646    0.052676    0.146440    11.00000    0.01541    0.02347 =
         0.00708   -0.00069    0.00268    0.00045
AFIX  33
H3A   2    0.077501    0.104380    0.174380    11.00000   -1.50000
H3B   2    0.164924   -0.016744    0.185503    11.00000   -1.50000
H3C   2    0.107879   -0.015489    0.100859    11.00000   -1.50000
AFIX   0
N4    1    0.147955    0.250000   -0.022404    10.50000    0.01842    0.01951 =
         0.01010    0.00000   -0.00150    0.00000
H4A   2    0.096861    0.330346   -0.019664    11.00000   -1.50000
H4B   2    0.190521    0.250000   -0.067194    10.50000   -1.50000
N5    1    0.098908   -0.250000    0.379726    10.50000    0.02773    0.02662 =
         0.02262    0.00000   -0.01804    0.00000
HKLF 4

END
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14楼2010-06-17 14:59:09
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hao_jian

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
对了，你那个莫名其妙的N5应该是水分子或氨分子吧？应该把H也加上。其他的电荷都平了

[ Last edited by hao_jian on 2010-6-17 at 15:06 ]
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15楼2010-06-17 15:03:43
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hao_jian

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
天呐，还有问题，其他N也不能用afix33，因为你要靠它找氢键。
而且你的N1和N4上的H用afix33找的，也不准，得重新定准H，再用我的办法分割H。
整个得推倒重来
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16楼2010-06-17 15:11:05
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-17 08:03:43:
对了，你那个莫名其妙的N5应该是水分子或氨分子吧？应该把H也加上。其他的电荷都平了

[ Last edited by hao_jian on 2010-6-17 at 15:06 ]

是的，那个N5是配体之外的氨分子，对它的加H也有问题，具体请看
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2146757&pid=718391&page=1#pid718391
谢谢相助！！
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17楼2010-06-17 19:38:17
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
问题已经解决了。只要强制限定H1B和H4B的y坐标是0.25，也就是说在镜面上就可以了。谢谢大家！
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18楼2010-06-17 19:40:05
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-17 14:59:09:
把这个存成ins文件再修几轮

TITL jzjun10a in Pnma
CELL 0.71073  13.2903   7.5220  15.0990  90.000  90.000  90.000
ZERR    4.00   0.0027   0.0015   0.0030   0.000   0.000   0.000
LATT  1
SYMM 0 ...

高手，您什么这么处理，能解释一下吗？我也遇到这样的问题，谢谢！
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19楼2010-06-18 10:22:53
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hao_jian

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yunruirui:谢谢交流，欢迎回帖！ 2010-06-18 12:53:58
引用回帖:
Originally posted by 文言文 at 2010-06-18 10:22:53:

高手，您什么这么处理，能解释一下吗？我也遇到这样的问题，谢谢！

18楼说的就是
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20楼2010-06-18 11:02:54
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