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奥古拉斯

无虫 (小有名气)

[交流] 【原创】晶格优化中ISIF取值的探究(六方MgO为例) 已有6人参与

一、目的:搞清楚用vasp进行晶格优化中ISIF值的重要性
二、方法:采用分步优化和一次性优化两种方法探究
三、重点参数说明:
       ISIF:2->relax ions?/Y; || change cell shape?/N; || change cell volume?/N
                 3->relax ions?/Y; || change cell shape?/Y; || change cell volume?/Y
                 4->relax ions?/Y; || change cell shape?/Y; || change cell volume?/N
                 5->relax ions?/N; || change cell shape?/Y; || change cell volume?/N
                 6->relax ions?/N; || change cell shape?/Y; || change cell volume?/Y
                 7->relax ions?/N; || change cell shape?/N; || change cell volume?/Y
     POSCAR:
a
0.0              -1.0     0.0
0.8660254037844   0.5     0.0
0.0               0.0    1.6230529595
2
Direct
0.6666666666666667    0.3333333333333333 0.750
0.3333333333333333    0.6666666666666667 0.250

四、实验步骤:
A、采用分步优化法:
      算法原理:
      a.先进行一次驰豫优化计算
      b.将CONTCAR拷贝成POSCAR
      c.再进行一次静态计算,求出总能和体积,拟合状态方程,得出晶格常 数

     I、取ISIF=2时:(#上下对应。上行为系列缩放系数;下行为相应的总能;所取CONTAR&volume为缩放系数取3.71时的结构情况)
  2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71   -0.09768706 -2.60381322  -2.62609278 -2.62612787 -2.62612791 -2.60064488  -2.59725747 -2.59725252 -2.597253
volume of cell :       71.78
CONTCAR:
3.710000000000000
     0.0000000000000000   -1.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.8660254037844000    0.5000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.6230529595000000
                              
    II、取ISIF=3时:
2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71
-1.47880875 -3.56749270  -3.57829654 -3.57830700 -3.57830701 -3.55534231 -3.55344206 -3.55344601 -3.553446
volume of cell :       43.12
CONTCAR:
3.710000000000000
     0.0000000000000000   -0.8480309609621116    0.0000000000000000
     0.7344163553888973    0.4240154804810558    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.3556928126902820
                                       
    III、取ISIF=4时:
2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71
-0.24918897 -2.60258815 -2.63108804 -2.63118786 -2.63118806 -2.60762910 -2.60458644 -2.60459724 -2.604597
volume of cell :       71.78        
CONTCAR:
3.710000000000000
     0.0000000000000001   -1.0553127846071310    0.0000000000000000
     0.9139276804085778    0.5276563923035652    0.0000000000000000
     0.0000000000000001    0.0000000000000000    1.4573715661012910

  IV、取ISIF=5时:
2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71
-0.24918897 -2.60258815 -2.63108804 -2.63118786 -2.63118806 -2.60762910 -2.60458644 -2.60459724 -2.604597
volume of cell :       71.78
CONTCAR:
3.710000000000000
     0.0000000000000001   -1.0553127846071310    0.0000000000000000
     0.9139276804085778    0.5276563923035652    0.0000000000000000
     0.0000000000000001    0.0000000000000000    1.4573715661012910

V、取ISIF=6时:
2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71
-1.47880875 -3.56749270 -3.57829654 -3.57830700 -3.57830701 -3.55534231 -3.55344206 -3.55344601 -3.553446
volume of cell :       43.12
CONTCAR:
3.710000000000000
     0.0000000000000000   -0.8480309609621116    0.0000000000000000
     0.7344163553888973    0.4240154804810558    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.3556928126902820

VI、取ISIF=7时:
2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71
-1.28296288 -3.56234825 -3.57418319 -3.57419641 -3.57419642 -3.55112710 -3.54922372 -3.54922856 -3.549229
volume of cell :       43.07
CONTCAR:
3.710000000000000
     0.0000000000000000   -0.8434465875014347    0.0000000000000000
     0.7304461715115043    0.4217232937507173    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.3689584800243790
B:采用一次优化法:
与上面方法不同的是INCAR中取ISIF=3,取定的实验缩放系数a=3.21,计算的精度选得更高,且仅做一次优化。
结果为:
TOTEN  =        -3.549568 eV
volume of cell :       43.12
CONTCAR:
Mg-hex                                 
    3.210000000000000   
     0.0000000000000000   -0.9801232359458133    0.0000000000000000
     0.8488116211684474    0.4900616179729067    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.5669819270266370
   2
Direct
  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.7500000000000000
  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.2500000000000000

结论:
1、特殊位置的粒子随晶格形状的改变而变化,不论允许驰豫与否。
2、不同ISIF的取值对晶格优化影响不大,本例中缩放系数均在3.21~3.31之范围内
3、采用分步优化法得出的优化晶格比较可靠
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zhoudq

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 奥古拉斯 at 2010-06-07 17:14:58:
一、目的:搞清楚用vasp进行晶格优化中ISIF值的重要性
二、方法:采用分步优化和一次性优化两种方法探究
三、重点参数说明:
       ISIF:2->relax ions?/Y; || change cell shape?/N; || change cell vo ...

当ISIF=4时其他参数都不做任何修改就能获得收敛吗?为什么我计算时当ISIF=4时能量就只能达到1E+2量级呢?
7楼2010-06-09 10:20:46
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查看全部 10 个回答

xirainbow

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xiaohunhun(金币+1):谢谢 2010-06-08 23:39:11
做的非常好;)
谢谢;)

有个小问题:)
    “II、取ISIF=3”,和“B:采用一次优化法”
都是ISIF=3.这两个有什么区别呢?
还有,为什么有的volume of cell 是七十多,有的四十多呢?
谢谢;)
2楼2010-06-08 14:47:21
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奥古拉斯

无虫 (小有名气)

★ ★
xiaohunhun(金币+2):谢谢 2010-06-08 23:39:26
引用回帖:
Originally posted by xirainbow at 2010-06-08 14:47:21:
做的非常好;)
谢谢;)

有个小问题:)
    “II、取ISIF=3”,和“B:采用一次优化法”
都是ISIF=3.这两个有什么区别呢?
还有,为什么有的volume of cell 是七十多,有的四十多呢?
谢谢;)

谢谢鼓励

1. Q:  “II、取ISIF=3”,和“B:采用一次优化法”
        都是ISIF=3.这两个有什么区别呢?
    A:“II、取ISIF=3”,这样取定ISIF后,会对所有的缩放系数试探值下的结构全优化,也就是在每次优化过程中离子可以驰豫,晶格形状允许改变。这样就得到了一系列的V~E数对,然后进行状态方程的拟合,从而得到最稳定的结构情况;而“B:采用一次优化法”,仅仅是取定了实验上得到的缩放系数,在这个基础上进行结构的全优化,而且仅作这一次运算,所得到的稳定结构情况在输出文件CONTCAR中。
2.Q:,为什么有的volume of cell 是七十多,有的四十多呢?
   A:看I和II这两种情况,I是ISIF=2,II是ISIF=3,然后你看再前面的ISIF参数说明,就会知道ISIF=2在优化过程中要保持c/a,以及volume不变,而ISIF=3则相反;同时我已经说明了我列出的volume of cell都是在缩放系数为3.71时的情况。据此可以这样看,ISIF=2求出的结构是ISIF=3的初始结构,经过可变晶格的优化计算,当然会得到与初始结构完全不同的结构。
呵呵,希望我解释清楚了
  
3楼2010-06-08 17:16:19
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xirainbow

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xiaohunhun(金币+2):谢谢 2010-06-08 23:39:36
非常非常感谢您给出如此详细的说明;)

但是对于第一个小问题,我依然有些疑问:)
既然ISIF都是=3,那么vasp将对所有的原子位置和晶包参数进行优化。
那么A和B中的ISIF=3的时,在相同的输入结构的前提下,他们的计算过程和结果有差别么?

另:2.91              3.01               3.11              3.21              3.31              3.41              3.51              3.61 3.71
以上的这几个参数,是您人工指定的,还是vasp在优化时,自己产生的中间结构?
如果是vasp自己产生的,您如何保证A中的ISIF=不同数值的时候,都取这几个参数?
再:将V~E进行状态方程的拟合。vasp有提供这个功能么?还请指教;)

[ Last edited by xirainbow on 2010-6-8 at 20:36 ]
4楼2010-06-08 20:27:41
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