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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于代谢组学
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zhf4539

木虫 (小有名气)

木虫

我来回答

★ ★
zns_lyx(金币+2):谢谢前辈对流程的大概介绍，浑沌沌的思路清晰很多啊，嘻嘻～～ 2010-06-12 21:11:02
lstt09nk(金币+2):很热心~~ 2010-06-16 10:58:02
说实际的，我建议你用毛细管电泳做定量，你刚接触不要去做组学，组学是个很大的概念。简单的和你说下吧，一般组学是用LC-MS做的比较多，而且一般是用TOF检测样本中的全部代谢物指纹图谱，这就要求样本的处理尽量的简单以免处理过程中丢失任何代谢物。做完后可以用比如waters的MassLynx软件找出一些差异性比较大的代谢物，也就是所谓的生物标志物，找到比如前100号后可以用simca等化学计量学软件对样本进行聚类分析，常见就可以做PCA,PLS-DA等分析，看你样本分组的分离情况。呵呵，加油吧，后生们
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喜欢科研
11楼2010-06-12 20:28:20
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zhf4539

木虫 (小有名气)

木虫
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
加我Q吧，309893932
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喜欢科研
12楼2010-06-14 11:11:39
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yzhang_nju

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-06-17 00:15:13
NMR样品处理比较简单，但是后期代谢物判别比较麻烦，搞不好会被全盘否定
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13楼2010-06-14 11:16:52
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zns_lyx

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yzhang_nju at 2010-06-14 11:16:52:
NMR样品处理比较简单，但是后期代谢物判别比较麻烦，搞不好会被全盘否定

那用毛细管电泳呢？ 会有什么问题出现么？ 谢谢前辈的回答！
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14楼2010-06-15 09:35:50
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yzhang_nju

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+1):热心虫友，欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-06-17 00:15:22
毛细管电泳没做过，呵呵
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15楼2010-06-16 10:22:37
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zns_lyx

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yzhang_nju at 2010-06-16 10:22:37:
毛细管电泳没做过，呵呵

谢谢回帖交流  嘻嘻～～

[ Last edited by reasonspare on 2010-6-17 at 08:12 ]
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16楼2010-06-16 22:42:13
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reasonspare

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+2):热心版主。 2010-06-17 09:00:22
引用回帖:
Originally posted by zns_lyx at 2010-06-16 22:42:13:

谢谢回帖交流  嘻嘻～～

[ Last edited by reasonspare on 2010-6-17 at 08:12 ]

关于代谢组学研究，主要涉及两块内容，分离 和鉴定。同时有两个层次：定性和定量。
既然你的研究对象已经确定是：尿液（包括不同处理方式的尿液）
那末第一步：背景知识：尿液主要有哪些成分（有些是你感兴趣的，有些甚至干扰你的目标）
另外关于尿的研究非常多。你就要就明白，大概那类代谢物和你的处理有关。
确定了这些，你就可以考虑选择分离的方法，，，也就是你说的毛细管电泳。
在这方面资料肯定不少。
其中最关键的是确立分离参数。
从原理上讲，第一：你的大概的目标，能不能通过电泳的方式分离，并检测。分辨力和灵敏度如何。
第二;如果上面一切可以，你就可以确定参数进行分析。并找到差异，（并进一步确定，该差异的重复性，真实性。通常通过一些参照物，标准物，来确定）
第三：鉴定，据我所知毛细管电泳，在没有标准物的话，很难定性确定其结构。可能你要进一步富集纯化该组分：进行IR MS 或者NMR, 等分析
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大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
17楼2010-06-17 08:12:27
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zns_lyx

银虫 (小有名气)
reasonspare:这就是为什么大家来这里的原因。 2010-06-18 06:27:41
引用回帖:
Originally posted by reasonspare at 2010-06-17 08:12:27:


关于代谢组学研究，主要涉及两块内容，分离 和鉴定。同时有两个层次：定性和定量。
既然你的研究对象已经确定是：尿液（包括不同处理方式的尿液）
那末第一步：背景知识：尿液主要有哪些成分（有些是你感兴 ...

谢谢斑竹！在百度悬赏200分都没人理我，小木虫真是贵人多啊  ，太感动了～
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18楼2010-06-17 21:01:30
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hu-xue-jun

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我做的代谢组学包括尿液的，用的是NMR分析，除了分析尿液还有血清，后期的分析正在分析，工作量很大，对化学计量学不是很懂，不过，实验设计的时候，看你的研究，首先应该有代谢笼，还有设计急性实验还是慢性实验。。。
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19楼2012-03-03 15:14:51
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