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zns_lyx

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】关于代谢组学已有6人参与

各位大侠，
我是一个小小大三本科生，由于是应用化学专业，对生物化学、药学等都是门外汉。导师是药学的，上次写科技创新项目时，查了研究热点，看到代谢组学很热门，就傻乎乎地写上去了，没想到项目也批下来了。现在多看了点文献和论坛，才知道其中深不可测。。。555～～不知路过的大侠中有没做过尿液测定的，能否指点下迷津。
项目做的是XXX对生物代谢的影响，XXX是挥发性物质。对于本科生，我该怎么设计才能让实验难度不超出自己的能力范围又做得好呢？不知道做尿液的指纹图谱难度大不？我是做毛细管电泳用紫外测容易点呢（这个方法只能说明哪些峰有差异，但不能确定到底是什么物质有差异），还是用超高效液相色谱质谱联用做容易点（解质谱图是不是很难？有没软件可以直接用的？）？谱图出来后后面的海量数据该怎么办呢（看文献都是有非监督的PCA，可具体是要怎么做呢？）？能用数学软件解决么？是不是要有很强大的数学功底？对于本科生我们该怎么做使自己的课题有一点意义但又难度不会很大呢？

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1楼 2010-06-05 16:16:12

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reasonspare

木虫 (著名写手)

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+2):热心版主。 2010-06-17 09:00:22

引用回帖:

Originally posted by zns_lyx at 2010-06-16 22:42:13:

谢谢回帖交流嘻嘻～～

[ Last edited by reasonspare on 2010-6-17 at 08:12 ]

关于代谢组学研究，主要涉及两块内容，分离和鉴定。同时有两个层次：定性和定量。
既然你的研究对象已经确定是：尿液（包括不同处理方式的尿液）
那末第一步：背景知识：尿液主要有哪些成分（有些是你感兴趣的，有些甚至干扰你的目标）
另外关于尿的研究非常多。你就要就明白，大概那类代谢物和你的处理有关。
确定了这些，你就可以考虑选择分离的方法，，，也就是你说的毛细管电泳。
在这方面资料肯定不少。
其中最关键的是确立分离参数。
从原理上讲，第一：你的大概的目标，能不能通过电泳的方式分离，并检测。分辨力和灵敏度如何。
第二;如果上面一切可以，你就可以确定参数进行分析。并找到差异，（并进一步确定，该差异的重复性，真实性。通常通过一些参照物，标准物，来确定）
第三：鉴定，据我所知毛细管电泳，在没有标准物的话，很难定性确定其结构。可能你要进一步富集纯化该组分：进行IR MS 或者NMR, 等分析