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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】关于1xbp蛋白的准备
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xufund

至尊木虫 (知名作家)

[交流] 【求助】关于1xbp蛋白的准备 已有2人参与

用autodock做docking，在准备蛋白文件去水分子时，老是出错，提示没有新的水分子可去（大意）。继续往下走，不能加氢。1XBP是从PDB下的。求高手帮忙。谢谢！
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1楼 2010-06-01 19:48:49
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wuhaigang

木虫 (著名写手)

奋斗的虫虫
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-02 07:31:24
你试一试用其他的软件进行除水除盐   我估计是因为你的受体分子没有提前加氢 使他的水是一单氧的形式存在的
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2楼2010-06-01 22:21:32
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xufund

至尊木虫 (知名作家)
试了Molegro Data Modeller,也是报错
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3楼2010-06-02 19:57:26
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