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niansi521

木虫 (小有名气)

[交流] 【请教】哪位知道这些a类错误是什么引起的? 已有4人参与

PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H10B .. H11B .. 1.45 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H11B .. H10D .. 1.39 Ang.
PLAT772_ALERT_2_A Suspect O-H Bond in CIF: O10' -- H10B .. 1.39 Ang.

刚学,还不太会见笑了
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niansi521

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by Inorg@USF at 2010-05-31 11:38:48:
H10B .. H11B和H11B .. H10D氢键太短,需要重现定位氢原子位置。看来是由于O10' -- H10B键长问题引起的,看看你的 .lst 查看一下键长应该是多少,然后用DFIX限制一下就好了。

如下:
Default effective X-H d ...

谢谢
5楼2010-06-01 17:34:45
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yqy86

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
niansi521(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-05-31 08:58:05
氢原子对应的母原子有问题
现在成木虫了
2楼2010-05-30 22:47:20
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forever1706

禁虫 (知名作家)

★ ★
niansi521(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-05-31 08:58:12
我觉得可能楼主可能是OH加氢出现的问题,OH键的方向不对,造成两个OH的H原子之间距离过短,产生 该A类错误。找个有经验的老师帮你做。
3楼2010-05-31 08:43:38
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)

★ ★
niansi521(金币+1):谢谢参与
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流~ 2010-09-02 23:22:39
H10B .. H11B和H11B .. H10D氢键太短,需要重现定位氢原子位置。看来是由于O10' -- H10B键长问题引起的,看看你的 .lst 查看一下键长应该是多少,然后用DFIX限制一下就好了。

如下:
Default effective X-H distances for T = -100.0 C

AFIX m =    1     2     3     4   4[N]  3[N]  15[B]  8[O]   9   9[N]   16
d(X-H) =  1.00  0.99  0.98  0.95  0.88  0.91  1.12  0.84  0.95  0.88  0.95

Note that these distances are chosen to give the best fit to the X-ray data
and so avoid the introduction of systematic error.  The true internuclear
distances are longer and do not vary with temperature !  The apparent
variation with temperature is caused by libration.
There is a will,there is a way.
4楼2010-05-31 11:38:48
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