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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】求教把siesta安装在cluster上的安装方法
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caqhero

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求教把siesta安装在cluster上的安装方法 已有7人参与

本人想学习siesta软件，但不知道怎么样安装在cluster上，请大侠指点！谢谢！
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1楼 2010-05-26 17:00:21
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且汀风吟

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by caqhero at 2010-06-07 10:10:27
谢谢大家的帮助，我配好了怎么发现，cluster运算并不好！计算速度还不如单机四核跑得快呢？我有三台机器，每台都是四核的。用cluster之后每台机器好像只有一个核在计算。这是怎么回事阿？

有可能在Cluster上运算的时候你只用了1个processor，并行版本需要设置ProcessorY
Bash Scripts需要加上：mpirun -np [# of processor] siesta < input.fdf > output
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12楼2014-02-22 06:21:46
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xhsh

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-05-27 11:06:38
和在单机上安装是一样的。你需要需要安装编译器、blas、lapack、BLACS、Scalapack和mpi并行库等。然后才能编译siesta。
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2楼2010-05-26 17:45:51
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caqhero

金虫 (正式写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-05-27 11:06:43
引用回帖:
Originally posted by xhsh at 2010-05-26 17:45:51:
和在单机上安装是一样的。你需要需要安装编译器、blas、lapack、BLACS、Scalapack和mpi并行库等。然后才能编译siesta。

大侠，我在单机双核上安装成功，但是不会配置cluster。还希望大侠指点。主要是不会用mpich配置cluster，我用的是ifort 编译器，数学库是Intel的mkl。请大侠多多指点。谢谢！
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3楼2010-05-26 17:58:32
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xhsh

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
在单机上你会安装mpich吗？如果单机上会，那在cluster的所有节点上都进行同样的安装就可以了。
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4楼2010-05-26 21:06:13
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