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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】大家觉得这个结果怎么解释? 已有8人参与

最近PCR,电泳时发现除了目的带以外,多了一些不明条带,随着电泳时间的延长而逐渐减弱,直至消失。后来实验证实是loading buffer的问题。我用的buffer是takara随内切酶提供的10*buffer,向该公司反映后,该公司回复说是该buffer只能用于内切酶后电泳,不推荐用于PCR产物电泳,其解释是其中不明条带是SDS。
不知道大家碰到过这种情况没有?
详见下图,其中箭头标示的都是不明条带。


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VX:19192310212;公众号:生物技术与IVD
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gandalf886

银虫 (小有名气)

★
snoopyzxx(金币+1):谢谢参与
10*buffer里有聚蔗糖,可与EB结合,在电泳时间较短时可在紫外灯下看到亮带。
你是刚做实验没几天吧,说实在的有时间做这些图研究这个,不如干点更有意义的事儿。
14楼2010-05-26 15:52:43
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主

★
snoopyzxx(金币+1):谢谢参与
始终觉得是pcr扩增的一些非特异性的条带,它们大小不一但是相差不是很大,随着电泳时间的加长,逐渐分开并扩大稀释,就看不到了;
居然还有这种原因(loading buffer的原因),没有想到过;
可是不加pcr产物的任何点都没有这条带啊
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼2010-05-25 22:24:11
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

大家注意第一张图右边有各泳道的上样情况。
其中有三组对照实验,每组都有只有loading buffer的孔,只有loadingbuffer的孔里也有非目的带。
而且6、7、8、9是用的另一公司的作为对照,这一组里面没有不明条带。所以从这里我判断是loading buffer的问题。
VX:19192310212;公众号:生物技术与IVD
3楼2010-05-25 22:33:59
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

以下为上面图片的较清晰版。
分别对应上面的图。




[ Last edited by snoopyzxx on 2010-5-25 at 22:41 ]
VX:19192310212;公众号:生物技术与IVD
4楼2010-05-25 22:39:07
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