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ottolzm

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】请教关于PCR的问题!!! 已有9人参与

最近做了一下PCR 发现自己的PCR没有结果 想寻求以下原因 是引物的问题 还是模板的问题  原先的引物为21bp  15bp  (没加酶切位点),21bp  19bp (没加酶切位点) 这样的酶切位点是不是太短了  用不用再加长点(待扩增片段 第一段长 798bp  第二段 831bp)还有我现在用的是BBI 公司的Taq DNA polymerase 模板量为 0.5 微升 做了一次 扩增出来的是1500bp 的条带  加到1微升的时候 没有扩增出来  实验室有人建议加到3微升试试 不知道坛子里的各位大侠能否帮帮忙 优化一下反应条件。小弟在此 谢谢各位!!!
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amilie030312

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
先做梯度看看,找到最适合的退火温度。找到合适的温度之后再看是否需要增加循环数和降低温度来增强扩增的产物产量。
12楼2010-05-26 17:16:11
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jasco

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):欢迎多多交流~~ 2010-05-24 12:17:02
引物长度不是关键,主要看tm值,是否有二级结构等,

扩出来1500bp应该是非特异性扩增产物,所以可以提高引物tm值,
2楼2010-05-24 11:03:06
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
酶的量0.5已经够用了,主要还是PCR退火温度
3楼2010-05-24 11:18:08
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ottolzm

木虫 (正式写手)

呵呵 谢谢 楼上的两位大侠  我已经做了温度梯度  在50度的时候 非特异性条带很多 也包括我想要的 但是当我的Tm调节到68度的时候 什么都没有 (引物带酶切位点的Tm为69.8 而不带酶切位点的Tm为64.7)  请教一下各位大侠 能否在提高退火温度 还是 重新设计引物?
4楼2010-05-25 08:45:26
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