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victoria7850

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化过程中结构中的两个原子为什么越跑越近,直至相接已有11人参与

RT。
大分子结构,优化过程中,O和H越跑越近,直至相接。这样对整个结构有没有什么影响?
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victoria7850

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-05-24 12:22:07:
第一、初始构型错误;
第二、基组指定错误。
你给的信息完全不够进行判断的,这么遮遮掩掩的,让大家来猜。
都这么多天了,如果真的想问,贴你的输入输出文件。

没有遮掩,以为这种是常见错误,大家完全可以不看作业就解决的。问题如下:

Symmetry turned off by external request.
Stoichiometry    C12H23Cl3CrN2O6
Framework group  C1[X(C12H23Cl3CrN2O6)]
Deg. of freedom   135
Full point group                 C1
Rotational constants (GHZ):      0.3354467      0.1012775      0.0950500
Basis read from rwf:  (5D, 7F)
Warning:  center  25 has no basis functions!
Warning:  center  35 has no basis functions!
Warning:  center  37 has no basis functions!
Warning:  center  39 has no basis functions!
Warning:  center  41 has no basis functions!
Warning:  center  46 has no basis functions!
Pseudo-potential data read from rwf file.
Integral buffers will be    131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off.
   478 basis functions,   853 primitive gaussians,   497 cartesian basis functions
   111 alpha electrons      111 beta electrons
       nuclear repulsion energy      3210.4770422372 Hartrees.



Warning!  O  atom   25 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
This is less than a minimal basis set!
Warning!  O  atom   35 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
This is less than a minimal basis set!
Warning!  O  atom   37 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
This is less than a minimal basis set!
Warning!  O  atom   39 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
This is less than a minimal basis set!
Warning!  O  atom   41 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
This is less than a minimal basis set!
Warning!  O  atom   46 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
This is less than a minimal basis set!
19楼2010-05-24 16:10:08
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mengfc

金虫 (正式写手)


aylayl08(金币+1): 2010-05-24 08:04:25
相接?计算有问题吧?
2楼2010-05-23 15:04:43
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子


aylayl08(金币+1): 2010-05-24 08:04:20
貌似不大可能。
愿好运与快乐伴随你!
3楼2010-05-23 15:20:44
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vigaryang

木虫 (正式写手)


aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-05-24 08:04:14
相接?顶多相互靠近而形成氢键吧?
4楼2010-05-23 15:55:13
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