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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

[交流] 【求助/交流】(5.20更新)PCR产物电泳没有条带,why? 已有10人参与

今天偶做了一个pcr,目的片段1800多bp,退火温度63,延伸2Min,不料做完之后电泳没有条带!不知道是何原因?

ps:100微升体系,10 buffer 5 DMSO  75 ddH2O dNTP 引物 模板 酶 都是2 没有加氯化钾,因为近来实验室都说加了氯化钾做不出来!

请高手帮忙分析原因?
还有我明天想做一个梯度,不知道设几个梯度好?还有如果做梯度的话,每一管做多少微升合适?

谢谢高手了!

5.20更新今天中午又去做了一个pcr,这次我做的是10微升体系的,分别用两种酶(鼎国的和pfu酶)各做了五个梯度,54 56 58 60 62度,结果下午去跑电泳还是没有任何条带,我考虑到是不是引物没有稀释均匀的问题,随后又对我的引物进行了电泳,点了5微升,有条带很亮!

目前已经可以排除引物的问题(因为我引物设计完成后让师姐都检查了一下,而且今天也排除了引物稀释均匀的问题);
现在我也不知道到底是什么问题了?大家有什么更好的建议没有?
有哪位仁兄用过pcr增强剂?

[ Last edited by 天使托 on 2010-5-20 at 18:45 ]
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木子

银虫 (小有名气)

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scelab(金币+3):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-05-19 09:12:14
我的建议:
1、看看引物是否设计的正确
2、看看模板纯度是否很高
3、优化反应体系,如镁离子的浓度,引物浓度等,还有就是你的片段比较长,是否考虑预变性
4、退火温度的优化,可以做梯度PCR
5、梯度PCR一般从高于退火温度5度开始,到低于5度,可以每次降1度或者2度,体系25微升就可以乐,可以参阅相关文献,时间久了好多忘了
6、氯化钾,我从来没有加过,不知道你们是依据什么原理加的,镁离子的倒是需要优化的
希望对你有所帮助

[ Last edited by 木子 on 2010-5-19 at 08:36 ]
12楼2010-05-19 08:35:19
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人


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5 DMSO   氯化钾

我从来没加过这东西啊

是不是buffer里有的啊

多做几次吧
小木虫之有关部门负责人
2楼2010-05-18 22:31:10
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天使托

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T.Shen

引用回帖:
Originally posted by scelab at 2010-05-18 22:31:10:
5 DMSO   氯化钾

我从来没加过这东西啊

是不是buffer里有的啊

多做几次吧

楼上的你们做pcr都加什么?
我们实验室其实原来都不用加什么氯化钾,等等,只需要加增强剂就可以了~原来很好做,最近大家的pcr都不太理想!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
3楼2010-05-18 22:34:57
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dNTP
Mg
buffer
ddH2O
primer
taq E

就这几样
扩的好好的
小木虫之有关部门负责人
4楼2010-05-18 22:36:47
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