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569480531

金虫 (小有名气)

linda

[交流] 【求助】反应物和产物颠倒了 已有5人参与

我用TS找反应物和产物时,求算反应物却得到了产物,求算产物得到的是反应物,这是咋回事啊,我该怎样调整才能得到预期的反应物和产物呢?请高手指教,谢谢!
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★
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yzcluster(金币+1): 2010-05-11 16:16:06
看不懂你在说什么
TS找的是过渡态(有一个负本征值),而不是反应物或产物(本征值全为正)
2楼2010-05-11 11:21:06
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子

★ ★ ★
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zhou2009(金币+2): 2010-05-11 14:29:44
过渡态有过渡态的计算表征方法,看坛子里的帖子即可。
但从过渡态找反应物、产物的做法应该没有绝对的规定,从过渡态出发能够找到2个物种应该就可以了,哪个是反应物,哪个是产物有什么区别呢?正如把一个反应式掉个头,那反应物不是就变成产物了吗?
愿好运与快乐伴随你!
3楼2010-05-11 12:26:35
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

对不起了,我没说明白,我是先用TS找到了过渡态,然后用IRC找反应物和产物,用forward关键词找出的是我要的产物, 用reverse关键词找出的是我要的反应物。感谢两位指教,我明白quantumor前辈的意思了
4楼2010-05-11 14:03:03
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人

★ ★ ★
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gavinliu7390(金币+2):谢谢交流! 2010-05-13 19:17:00
引用回帖:
Originally posted by quantumor at 2010-05-11 12:26:35:
过渡态有过渡态的计算表征方法,看坛子里的帖子即可。
但从过渡态找反应物、产物的做法应该没有绝对的规定,从过渡态出发能够找到2个物种应该就可以了,哪个是反应物,哪个是产物有什么区别呢?正如把一个反应式 ...

不过我要问一下的是,虽然从直觉上正走倒走没有区别。但是,实际反应的时候所面临的势垒高度是不同的。比如,正走的时候“上坡”能量为E1,下坡为E2,但是倒走的时候,上坡能量就编成了E2,我觉得这对反应应该还是有影响的。
5楼2010-05-11 16:21:46
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yflchx

金虫 (正式写手)

★ ★
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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-05-13 19:17:13
定义PHASE选项试试。
6楼2010-05-12 09:55:05
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

引用回帖:
Originally posted by yflchx at 2010-05-12 09:55:05:
定义PHASE选项试试。

定义phase选项就可以确定反应物和产物了吗?如果是,用phase确定反应物和产物的原理什么啊。
7楼2010-05-13 15:46:18
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yflchx

金虫 (正式写手)

★ ★
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gavinliu7390(金币+1):thanks! 2010-05-13 19:17:29
Phase=(N1 N2 [N3 [N4]])
Defines the phase for the transition vector such that "forward" motion along the transition vector corresponds to an increase in the specified internal coordinate, designated by up to four atom numbers. If two atom numbers are given, the coordinate is a bond stretch between the two atoms; three atom numbers specify an angle bend, and four atoms define a dihedral angle.
8楼2010-05-13 16:02:42
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

谢谢了。
9楼2010-05-13 16:05:31
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