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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物化学 » 【求助】关于蛋白多肽合成与修饰的两个问题。
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abaiwoaini

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于蛋白多肽合成与修饰的两个问题。 已有4人参与

一、固相合成某多肽(比如AABBCCDDEE)：
法一：从羧基端的E开始,合成到氨基端的A。
法二：将序列反过来写EEDDCCBBAA，从羧基端的A开始，合成到氨基端的E。

请问如此两种方法得到的多肽，空间构象完全一致吗，是否合成的方向不同会产生影响？

二、将蛋白多肽经PEG修饰，如果完全在DMF（二甲基甲酰胺）介质体系中反应是否会对蛋白多肽的空间构象产生不可逆的影响。
见过有文描述“DMF（二甲基甲酰胺）作为高浓度膜变性剂能通过破坏多肽的二级结构而助溶。”不知这个影响是否可逆？

请虫友多指教!
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1楼 2010-05-09 15:02:47
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bluezhang

木虫 (小有名气)

您好

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wtf66(金币+1):谢谢参与 2010-05-19 13:17:16
我以前做过这方面工作谈一点感觉
1.这点可从生化关于蛋白质和多肽的命名中查找，确保合成序列完全一致，我以前合成过六十个以下氨基酸的多肽，空间构象没有问题。如果序列很长在有二硫键及氢键的作用有不同的 空间构象
2.不会影响其活性，在合成过程中DMF只是让多肽尽量舒展不蜷曲，把它从DMF中取出后就会恢复其自然状态，就如把老虎关在笼子里，只是限制他并不改变它，打开笼子老虎还会吃人。我们做过一百五十多个氨基酸的多肽都是在DMF状态下合成，最终都很好。我们合成过几百条多肽还没有出现您所说的情况。
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2楼2010-05-17 09:41:27
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abaiwoaini

银虫 (小有名气)
多谢虫友！

“我以前合成过六十个以下氨基酸的多肽，空间构象没有问题。”

这个序列您从两个方向合成后，构象一致？

您是如何判断构象的一致性的？
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3楼2010-05-18 22:53:19
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bluezhang

木虫 (小有名气)

您好！

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
刚看到您的信息，我接的多肽用固相合成法，都是从N端开始的，还没有做过接一条多肽用两种方式合成的，不过你放心，多肽和蛋白质还差太远，它们的空间结构复杂性还难以同蛋白质相提并论，做多肽合成要先把多肽合成出来，然后再探讨空间构想，如果先谈论构像再考虑合成，那我们的结晶牛胰岛素也合成不出来了，一句话放心做，不要庸人自扰
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4楼2010-06-02 21:06:10
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G_D1314

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by bluezhang at 2010-06-02 21:06:10
刚看到您的信息，我接的多肽用固相合成法，都是从N端开始的，还没有做过接一条多肽用两种方式合成的，不过你放心，多肽和蛋白质还差太远，它们的空间结构复杂性还难以同蛋白质相提并论，做多肽合成要先把多肽合成出 ...

从N端开始的多肽固相合成？这位大哥可以详细说说或者推荐一些文献让小弟学习一下么？
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我坚信我的等待，我坚持我的选择
5楼2015-04-24 17:24:54
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zhouruiyi203

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by bluezhang at 2010-05-17 09:41:27
我以前做过这方面工作谈一点感觉
1.这点可从生化关于蛋白质和多肽的命名中查找，确保合成序列完全一致，我以前合成过六十个以下氨基酸的多肽，空间构象没有问题。如果序列很长在有二硫键及氢键的作用有不同的 空间 ...

合成这么长的多肽，好厉害诶，请问您是用什么合成的？微波反应器？能参考一下您的实验步骤么？
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6楼2017-07-06 09:44:36
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