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原核生物的马甲

铜虫 (正式写手)

[交流] 【请教】请教两个晶体问题如何回复审稿人 已有3人参与

先一段交流:
之前大家总是觉得Journal of Chemical Crystallography审稿超级慢,但是最新发现也有快的,隔壁实验室2009年11月中旬投稿,1月份就给出审稿意见,2月份就on line了。我也投了一篇,也是去年11月份投稿,5月初也就是前两天就给审稿意见了,没有之前传说的要一年多,估计正式发表需要一大段时间吧!
再一段请教:
审稿意见minor revision除了用词、句子表达没大问题,但是提了两个关于晶体的问题,也算是硬伤吧,看看怎么回复审稿人好呢?

1. Table 1. Explain why the Goodness of Fit is so small. Perhaps incomplete refinement? Lack of refinement of weights?
2. The absolute configuration was established based on the synthesis but the presence of a heavy atom such as Br should help establish it. Why was it preferred to use the synthesis? How about the use of the Hooft parameter?

对于问题1,晶体的Goodness of Fit 是0.798,检查时是个C-level alert,是什么造成的呢?怎么处理?请教
对于问题2,CIF是这么写的:
        ==========
        _chemical_absolute_configuration  syn
        _refine_ls_abs_structure_details
        'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881'
        _refine_ls_abs_structure_Flack    0.021(6)
        ==========
不过,貌似不应该是syn 而是 ad,具体该怎么回复呢?请教
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
已接收
Nov. 11, 2009 submitted
May 10, 2010 accepted

[ Last edited by 原核生物的马甲 on 2010-5-11 at 08:08 ]
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原核生物的马甲

铜虫 (正式写手)

upupupup
2楼2010-05-09 14:13:05
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dongyang5028

金虫 (正式写手)

★ ★
eeqeeq0002(金币+2):谢谢参与 2010-05-10 14:28:14
原核生物的马甲(金币+5):谢谢,这个已经调了,就是这样子了,回复审稿人0.798,取两位0.80,符合IUCr规定0.8-2.0之间 2010-05-10 21:26:26
Goodness of Fit代表晶体的吻合度,应该在1.000左右,如1.032,0.999等,你的太小了,解决方法是调节WEITH右边的值,调小,每次稍调,然后精修,调到适合的值,你的Goodness of Fit就大了。
第二个问题,我所发表的CIF上没有这个,可能是因为程序解析软件的不同。
3楼2010-05-10 08:50:39
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zhousm

木虫 (正式写手)

★ ★
eeqeeq0002(金币+2):谢谢参与 2010-05-10 14:28:20
原核生物的马甲(金币+5):谢谢,改成ad了,确实是基于单晶衍射确定的,原先那个衍射仪操作人弄错了 2010-05-10 21:27:33
2. 你的晶体中含有重原子Br,因此晶体的绝对构型是可以通过单晶衍射(即基于‘ad’的方法)来确定的。故,查看你cif中的flack参数,如果接近于0,改syn为ad即可。
4楼2010-05-10 09:31:49
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