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qzhaosdu金虫 (著名写手)
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【转载】VC上的小游戏：在线蛋白质折迭 简介及安装包 已有2人参与
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Foldit是一个实验性的蛋白质折迭电子游戏，由华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系（同一批人中，很多人也参与创建Rosetta@home）联合共同开发。第一个beta公开测试版在2008年5月释出。 Foldit让全世界的玩家比赛设计蛋白质，而科学家们则可以研究玩家设计的蛋白质，看看是否能运用到新药中。 该程序让用户在工具辅助解谜，就能够得出实际的蛋白质模型。每当结构被变动，一个"分数"会根据折迭的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组，分享各自的方案。也有小组高分榜。 生物制造主要蛋白质结构的方式（蛋白质生物合成）在理性上已经为人类所了解，此即蛋白质DNA 测序的方法。决定蛋白质主要结构转化为功能性三围结构（蛋白质分子如何“折迭”）是更为困难的；虽然大致的程序已经为人所知，但蛋白质结构预测还是需要大量的计算。 Foldit尝试利用人脑天生的三维pattern matching能力。目前该程序出的谜题都是基于已被人们清楚了解的蛋白质；通过分析人类在解这些谜题时的直觉思考途径，研究者希望能改进现有蛋白质折迭软件所用的算法。 开发者Popovic说，“我们的目标是让任何人都能操作，即使他们根本不了解生物化学或蛋白质折迭”。 目前，这个游戏只能使用那些三维结构已被研究人员解决的蛋白质。 但Popovic说，“不久之后会引入我们还不知道解决之法的蛋白质”。 Foldit是结合众包与分布式计算所得的成果。  下载地址： ed2k://|file|%5B%E5%9C%A8%E7%BA%BF%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B4%A8%E6%8A%98%E5%8F%A0%E6%B8%B8%E6%88%8F%5D.Foldit.exe|22184484|f60c62f20712ca146a3c7897eecc1d01|h=lqbch646ippmdbmcsujtxu276snm36yv|/ |
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2楼2010-04-29 22:19:45
yalefield
金虫 (文坛精英)
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网格计算为科学研究提供了一种新的环境和平台，能够让科研用户在更深层次、更大范围共享信息、进行研究和开发。很多国家都开设了基于网格计算的e-Science项目。美国自然科学基金会与能源部、航天局等共同设立的科学数据全面开放访问（Full and Open Access）项目使其在科研信息化方面处于领先的位置。例如： 美国Indiana大学和Argonne国家实验室（Argonne National Laboratory，ANL）合作的XPort项目是一个围绕生物大分子X射线衍射结构分析而建立的网格系统，提供远程仪器使用规划、仪器操作、数据获取、筛选和分析等功能，用户可以远程提交任务，交互式控制任务执行，接收和分析初步运行结果以确定任务的正确性，还可以与其他用户即时交流。 欧洲的网格系统也有很多，如： 欧盟的EUDataGrid、EUROGRID、 意大利的INFN-Grid、 荷兰的DutchGrid、 北欧的NorduGrid 英国的e-Science。 网格也使得跨国、跨地区合作，商业公司与学术研究机构合作也越来越多。例如， 美国Accelrys公司、IBM公司与英国Cambridge大学等合作的MaterialsGrid系统，采用量子力学模拟计算材料物性，如弹性劲度、介电常数和光学性质等。该网格能自动搜索已有数据、计算缺失数据，构成一个巨大的动态信息共享网格。 又如， 德国Jülich研究中心、爱沙尼亚Tartu大学、英国Ulster大学、意大利Mario Negri药学研究院和匈牙利ComGenex公司共同维护的OpenMolGRID系统，为药物设计提供了从化学数据管理、分子结构优化、描述参数计算到构效关系建模的自动化无缝处理方案。 一些与科学计算相关的网格分布式计算项目 [ Last edited by yalefield on 2010-4-30 at 05:42 ] |
3楼2010-04-30 05:41:43
