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xiaowandouer木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】vasp编译时，报错：cannot find -lmkl_em64t已有5人参与
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vasp编译时报错： -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o -lmkl_lapack -L/opt/intel/mkl/10.2.5.035/lib/em64t -lmkl_em64t -lguide -lpthread ld: cannot find -lmkl_em64t make: *** [vasp] Error 1 请教：这个问题如何解决？ 数学库用的mkl 10.2.5.035，编译器Fortran 11.1，MPICH2 安装是参考了之前的帖子： 1.手把手vasp64位并行装机全套软件已测试，另外本人并行编译的makefile也给出 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1539206 2. 【讨论】VASP编译方法以及错误汇总 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1354235&fpage=0&view=&highlight=&page=1 基本均是按照这两个帖子设置的参数. 另外，根据abcasi的提示，我发现/opt/intel/mkl/10.2.5.035/lib/em64t 下面根本没有-lmkl_em64t 这是/opt/intel/mkl/10.2.5.035/lib/em64t 下面的所有文件： libfftw3xf_intel.a libmkl_intel_lp64.so libguide.a libmkl_intel_sp2dp.a libguide.so libmkl_intel_sp2dp.so libiomp5.a libmkl_intel_thread.a libiomp5.so libmkl_intel_thread.so libmkl_avx.so libmkl_lapack95_ilp64.a libmkl_blacs_ilp64.a libmkl_lapack95_lp64.a libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a libmkl_lapack.so libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.so libmkl_mc3.so libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a libmkl_mc.so libmkl_blacs_intelmpi_lp64.so libmkl_p4n.so libmkl_blacs_lp64.a libmkl_pgi_thread.a libmkl_blacs_openmpi_ilp64.a libmkl_pgi_thread.so libmkl_blacs_openmpi_lp64.a libmkl_scalapack_ilp64.a libmkl_blacs_sgimpt_ilp64.a libmkl_scalapack_ilp64.so libmkl_blacs_sgimpt_lp64.a libmkl_scalapack_lp64.a libmkl_blas95_ilp64.a libmkl_scalapack_lp64.so libmkl_blas95_lp64.a libmkl_sequential.a libmkl_cdft_core.a libmkl_sequential.so libmkl_core.a libmkl_solver_ilp64.a libmkl_core.so libmkl_solver_ilp64_sequential.a libmkl_def.so libmkl_solver_lp64.a libmkl_gf_ilp64.a libmkl_solver_lp64_sequential.a libmkl_gf_ilp64.so libmkl_vml_avx.so libmkl_gf_lp64.a libmkl_vml_def.so libmkl_gf_lp64.so libmkl_vml_mc2.so libmkl_gnu_thread.a libmkl_vml_mc3.so libmkl_gnu_thread.so libmkl_vml_mc.so libmkl_intel_ilp64.a libmkl_vml_p4n.so libmkl_intel_ilp64.so locale libmkl_intel_lp64.a 麻烦高手指点，谢啦！ |
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同问搂主，这个问题好像楼主并没有考虑，VASP是要可以在每台机器上都能各自运行才可以做并行计算的。首先确认在每台机器上都能运行串行版本，再尝试单台机器上的并行版本，最后再尝试多台机器的并行。 排除顺序如下， 查看楼主的错误信息，vasp: error while loading shared libraries: libmkl_lapack.so: cannot open shared object file: No such file or directory，应该是在某个机器上没有拷贝MKL的库文件。请从主节点拷贝至各节点机。并保持相同路径。（如果担心只是简单去掉#造成的错误，那就把路径填写完整。或者贴上来让大家看看。） 如果单台串行均可运行，则串行库文件准备没有问题，问题可能出在和并行有关的库文件上（时间有点久，所以不敢多说，意思应该是说和MKL库无关）； 如果单机并行可运行（一般至少是双核了吧？），说明单机并行环境正常，问题可能出在多机并行环境的组建以及并行硬件上。 上面先简略的说说，编译么，总得从小地方一步一步来，急不得。 |
12楼2010-04-30 23:04:29
lono75
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2楼2010-04-27 22:11:01
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4楼2010-04-28 10:46:23