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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 仿真模拟 » MATLAB » 【求助】生数据转换为DICOM
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飞扬2282

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 【求助】生数据转换为DICOM 已有3人参与

生数据512x512x260的raw，读取后转换为dicom格式512x512x260（转换为260幅512x512的二维数据）

[ Last edited by 飞扬2282 on 2010-4-23 at 15:33 ]
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1楼 2010-04-23 10:47:08
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anyuezhiji

银虫 (正式写手)

星空行者
★
kuhailangyu(金币+1):希望继续来参与！ 2010-06-08 14:53:37
?????

三维的？


二维很快可以搞定  三维的还真没碰到过
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暗月下没有留下风的痕迹，但它已经寂然飘逝。。By<暗月之寂>:tiger38:
2楼2010-04-23 14:35:43
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飞扬2282

荣誉版主 (著名写手)
转换为260幅512x512的二维数据
引用回帖:
Originally posted by anyuezhiji at 2010-04-23 14:35:43:
?????

三维的？


二维很快可以搞定  三维的还真没碰到过
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3楼2010-04-23 15:33:08
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anyuezhiji

银虫 (正式写手)

星空行者
飞扬2282(金币+10): 2010-04-24 08:24
引用回帖:
Originally posted by 飞扬2282 at 2010-04-23 15:33:08:
转换为260幅512x512的二维数据


理论上是可以做到的
但手头没有样本
没法测试
要不你发个样本到我邮箱 我测试下
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暗月下没有留下风的痕迹，但它已经寂然飘逝。。By<暗月之寂>:tiger38:
4楼2010-04-23 18:36:34
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dota

木虫 (著名写手)
★
飞扬2282(金币+5): 2010-04-24 08:23
adu886886(金币+1):谢谢提供意见 2010-04-24 11:12
搞清楚 RAW 的格式，放循环中，读入一组，立即存写，那样不会有太大问题 （大数据量，慢或死机现象！）。
大概要用到下面一些函数：

fopen
fseek
fread

dicomwrite
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5楼2010-04-24 01:08:53
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anyuezhiji

银虫 (正式写手)

星空行者
★
kuhailangyu(金币+1):欢迎积极参与 2010-06-08 14:55:00
引用回帖:
Originally posted by dota at 2010-04-24 01:08:53:
搞清楚 RAW 的格式，放循环中，读入一组，立即存写，那样不会有太大问题 （大数据量，慢或死机现象！）。
大概要用到下面一些函数：

fopen
fseek
fread

dicomwrite

楼上正解
关键是RAW 的格式要弄懂
具体可以参考
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1988003&fpage=13楼

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=19523106楼
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暗月下没有留下风的痕迹，但它已经寂然飘逝。。By<暗月之寂>:tiger38:
6楼2010-04-24 02:06:45
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飞扬2282

荣誉版主 (著名写手)
kuhailangyu:有人参与就应该适当给予金币鼓励！ 2010-06-08 14:54:47
我已经做到了，代码如下
CODE:
fid=fopen('C:\TDdownload\Img3D512 512 260 8bit.raw','r');
img=fread(fid,512*512*260,'uchar');
img =reshape(img, [512 512 260]);
img = uint16(img);
for i = 1:1:260
filename = strcat(num2str(i), '.dcm');
filename = strcat('C:\TDdownload\CT\',filename);
dicomwrite(squeeze(img(:,:,i)), filename);
end
fclose(fid);

但生成的dicom数据，做后续处理的时候还是有问题，可能matlab的dicom函数比较粗糙吧。我还是尝试用生数据直接可视化吧
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7楼2010-04-24 08:00:46
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dota

木虫 (著名写手)
★
anyuezhiji(金币+1):谢谢交流 2010-04-25 17:57
那很可能是你图像数据转换的问题，而不是Matlab里面 dicomwrite 的问题！

img = uint16(img);

[ Last edited by dota on 2010-4-24 at 23:14 ]
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8楼2010-04-24 23:13:22
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飞扬2282

荣誉版主 (著名写手)
anyuezhiji:楼上的意思是数据转换时出了问题 2010-04-25 20:20
引用回帖:
Originally posted by dota at 2010-04-24 23:13:22:
那很可能是你图像数据转换的问题，而不是Matlab里面 dicomwrite 的问题！

img = uint16(img);

[ Last edited by dota on 2010-4-24 at 23:14 ]

我程序里有这个语句啊
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9楼2010-04-25 09:01:04
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anyuezhiji

银虫 (正式写手)

星空行者
★ ★
adu886886(金币+1):AN版辛苦了 2010-04-26 10:05
kuhailangyu(金币+1):网络还没弄好吗？好久没来了 2010-06-08 14:55:18
引用回帖:
Originally posted by 飞扬2282 at 2010-04-25 09:01:04:



我程序里有这个语句啊

你的数据读进来时什么类型？？

如果开始储存时是用
'grayscale'
'truecolor'
等格式

img = uint16(img);
这一句可以不要

下面提供图像类型的像素类型转换的函数
引用回帖:
function     to         from
im2uint8      uint8      logical,uint8,uint16,double
im2uint16     uint16     logical,uint8,uint16,double
mat2gray      double     double
im2double     double     logical,uint8,uint16,double
im2bw         logical    uint8,uint16,double

[ Last edited by anyuezhiji on 2010-4-25 at 20:26 ]
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暗月下没有留下风的痕迹，但它已经寂然飘逝。。By<暗月之寂>:tiger38:
10楼2010-04-25 20:24:32
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