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飞扬2282

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[交流] 【求助】计算N幅图像中圆的中心点坐标【已解决】已有2人参与

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1楼 2010-04-12 11:17:29

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anyuezhiji

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飞扬2282(金币+20):我要读取的是SPE格式的文件，而且是N幅，在一个文件夹里，不知你有什么好办法，我再追加金币！ 2010-04-12 20:09
adu886886(金币+2):辛苦了 2010-04-13 08:26

下面的代码应该可以解决你的问题

引用回帖:

function Find_Center_of_circles

%%Find Center of circles from picture
%%PSL@CSU
%%QQ:547423688
%%Email:anyuezhiji@qq.com
%%Edit @ 2010.4.12

%边缘提取
I=imread('picture.TIF');
I=rgb2gray(I);
I=imadjust(I);
Image=I;
figure, imshow(I);

[m,n]=size(Image);
Model=zeros(m,n);
for i=1:m;
for j=1:n;
Model(i,j)=Image(i,j);
end
end

%观察目标的灰度范围
%如果imshow白色的点显示的图不是要查找的两个圆的边缘，调整Model<210
%L=bwlabel(mask)标记对象
mask=Model<210;
figure,imshow(mask);
L=bwlabel(mask);

%show出圆的边缘
for i=1:2
mask1=mask;
mask1(find(L~=i))=0;
BW = edge(uint8(mask1),'sobel');
figure,imshow(BW);
[r,c]=find(BW~=0);
eval(['edge',num2str(i),'=[r c];']);
end
save('edge.mat','edge1', 'edge2');

for i=1:2
eval(['edgei=edge',num2str(i),';']);
edgei=pixels2Coordinates(edgei);
[r,center]=findcenter(edgei,3)
figure
hold on
plot(edgei(:,1),edgei(:,2),'.');
plot(center(1),center(2),'r.');
end

function out=pixels2Coordinates(Pixs)
%在像素图片上建立坐标系
%Lx,Ly 长、宽方向像素
%x0 y0 坐标系原点这里取图像中点
Lx=1024;
Ly=768;
Tx=3.78;
Ty=3.78;
x0=(1+Lx)/2;
y0=(1+Ly)/2;
out=((Pixs(:,2)-y0))/Tx;
out=[out,(Ly-Pixs(:,1)-x0)/Ty];

function [R,C]=findcenter(edge,mode)
%mode1 相加取中点
%mode2 最小二乘拟合圆x^2+y^2+a(1)*x+a(2)*y+a(3)=0
%mode3 用遗传算法，找到一点和一个半径R，各点到这点的距离与R之差的平方和最小
[m,n]= size(edge);
switch mode
case 1
C=sum(edge)/m;
R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;
case 2
A=[edge(:,1) edge(:,2) ones(m,1)];
B=-[edge(:,1).*edge(:,1)+edge(:,2).*edge(:,2)];
a=A\B;
C=-.5*a([1 2])';
R = sqrt((a(1)^2+a(2)^2)/4-a(3));
case 3
save('edge_m','edge','m');
%[x, fval, reason]=ga(fitnessfcn,nvars,A,b,Aeq,beq,LB,UB,nonlcon,options)
C=sum(edge)/m;
R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;
options = gaoptimset('Generations',200,'InitialPopulation',[R,C],...
      'PopulationSize',50,'TolFun',1e-7,'TolCon',1e-7,'MutationFcn',@mutationadaptfeasible );
   %'PopulationSize',50,'TolFun',1e-7,'TolCon',1e-7,'Display','diagnose');
[sol, fval, exitflag] = ga(@f,3,[],[],[],[],[0,min(edge)],[2*R,max(edge)],[],options);
R=sol(1);
C=sol([2,3]);
fval
end

%适应度函数的matlab代码
function [eval]=f(sol)
load edge_m
R=sol(1);
C=sol([2,3]);
eval=sum((sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2)-R).^2)/m;

[ Last edited by anyuezhiji on 2010-4-12 at 21:42 ]

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2楼2010-04-12 18:17:40

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anyuezhiji

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adu886886(金币+2):辛苦了 2010-04-13 08:27

spe格式没碰到过
能存为JPG格式么

JPG格式是没问题的

文件多的话写个循环就可以了

引用回帖:

%%PSL@CSU
%%QQ:547423688
%%Email:anyuezhiji@qq.com
%%Edit @ 2010.4.12

files = dir('*.jpg ')；

k=length(files );

R=zeros(2*k,1);
C=zeros(2*k,2);

for i=1:k

I=imread([files(k).name]);

%读入图片

%开始图片处理
[r,c]=Find_Center_of_Circle(I)
R([2*i-1 2*i])=r;
C([2*i-1 2*i], : )=c;

end

%图片处理代码

引用回帖:

function [R,C]=Find_Center_of_Circle(I)

%%Find Center of circles from picture
%%PSL@CSU
%%QQ:547423688
%%Email:anyuezhiji@qq.com
%%Edit @ 2010.4.12

I=rgb2gray(I);
Image=I;
figure, imshow(I);

[py,px]=size(Image);
Model=zeros(py,px);
for i=1:py;
for j=1:px;
Model(i,j)=Image(i,j);
end
end

%观察目标的灰度范围
%如果imshow白色的点显示的图不是要查找的两个圆的边缘，调整Model<50
%L=bwlabel(mask)标记对象
mask=Model<50;
L=bwlabel(mask);

%show出圆的边缘
r=[];c=[];
for i=1:2
mask1=mask;
mask1(find(L~=i))=0;
BW = edge(uint8(mask1),'sobel');
[r,c]=find(BW~=0);
eval(['BW',num2str(i),'=BW;']);
eval(['edge',num2str(i),'=[r c];']);
end
Model=(BW1|BW2)*1;

for i=1:2
eval(['edgei=edge',num2str(i),';']);
[r,center]=findcenter(edgei,2)
R=[R;r];
C=[C;center]
Model(round(center(1)),round(center(2)))=1;
end
figure,imshow(Model);

function [R,C]=findcenter(edge,mode)
%mode1 相加取中点
%mode2 最小二乘拟合圆x^2+y^2+a(1)*x+a(2)*y+a(3)=0
%mode3 用遗传算法，找到一点和一个半径R，各点到这点的距离与R之差的平方和最小
[m,n]= size(edge);
switch mode
case 1
C=sum(edge)/m;
R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;
case 2
A=[edge(:,1) edge(:,2) ones(m,1)];
B=-[edge(:,1).*edge(:,1)+edge(:,2).*edge(:,2)];
a=A\B;
C=-.5*a([1 2])';
R = sqrt((a(1)^2+a(2)^2)/4-a(3));
case 3
save('edge_m','edge','m');
%[x, fval, reason]=ga(fitnessfcn,nvars,A,b,Aeq,beq,LB,UB,nonlcon,options)
C=sum(edge)/m;
R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;
options = gaoptimset('Generations',200,'InitialPopulation',[R,C],...
      'PopulationSize',50,'TolFun',1e-7,'TolCon',1e-7,'MutationFcn',@mutationadaptfeasible );
[sol, fval, exitflag] = ga(@f,3,[],[],[],[],[0,min(edge)],[2*R,max(edge)],[],options);
R=sol(1);
C=sol([2,3]);
fval
end

%适应度函数的matlab代码
function [eval]=f(sol)
load edge_m
R=sol(1);
C=sol([2,3]);
eval=sum((sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2)-R).^2)/m;

读入的图片

处理后输出的圆边缘和圆心

[ Last edited by anyuezhiji on 2010-4-14 at 01:04 ]

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3楼2010-04-12 21:16:13

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飞扬2282

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4楼2010-04-13 15:21:41

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★ ★
飞扬2282(金币+100):谢谢帮助，太感谢你了。 2010-04-13 23:54
adu886886(金币+2):非常感谢指导，欢迎常来仿真模拟板块 2010-04-14 08:11

引用回帖:

function Find_CirclesCenter

%%Find Center of circles from picture
%%PSL@CSU
%%QQ:547423688
%%Email:anyuezhiji@qq.com
%%Edit @ 2010.4.13

path='D:\Program Files\MATLAB71\work\CurrentWork\test\';
clear CResult;
n=0;
for i=1:720
filename=['6-',num2str(i),'.spe'];
if exist([path,filename],'file')
disp(['正在处理',filename]);
n=n+1;
img=ReadSpe([path,filename]);
mask=img<0.22;
   %figure;imshow(mask);
CResult(n).fname=['6-',num2str(i)];
CResult(n).R=[];
CResult(n).C=[];
[L,m]=bwlabel(mask);
   for i=1:m
mask1=mask;
mask1(find(L~=i))=0;
BW = edge(uint8(mask1),'sobel');
%figure,imshow(BW);
[r,c]=find(BW~=0);
%eval(['BW',num2str(i),'=BW;']);
%eval(['edge',num2str(i),'=[r c];']);
CircleEdge=[r,c];
[r,center]=findcenter(CircleEdge,2);
CResult(n).R=[CResult(n).R;round(r)];
CResult(n).C=[CResult(n).C;round(center([2 1]))];
end
CResult(n).num=m;
[tc,p]=sort(CResult(n).C(:,2));
CResult(n).C=CResult(n).C(p,: );
end
end

maxcm=0;
fidout=fopen([path,'CResult.txt'],'w');
for i=1:n
fprintf(fidout,'%-8s',CResult(i).fname);
cc=CResult(i).C;
[cm,cn]=size(cc);
if cm>maxcm
maxcm=cm;
end
for j=1:cm
fprintf(fidout,'\t\t圆心%d：(%5d，%5d)',j,cc(j,1),cc(j,2));
end
fprintf(fidout,'\n');
end
fprintf(fidout,'\n');
fprintf(fidout,'\n');

for j=1:maxcm
fprintf(fidout,'%%圆心%d坐标\n',j);
fprintf(fidout,'x%d=[',j);
for i=1:n
if j<=CResult(i).num
fprintf(fidout,'%5d',CResult(i).C(j,1));
else
fprintf(fidout,'  nan');
end
end
fprintf(fidout,']'';\n');
fprintf(fidout,'y%d=[',j);
for i=1:n
if j<=CResult(i).num
fprintf(fidout,'%5d',CResult(i).C(j,2));
else
fprintf(fidout,'  nan');
end
end
fprintf(fidout,']'';\n');
end

fclose(fidout);

function [R,C]=findcenter(edge,mode)
%mode1 相加取中点
%mode2 最小二乘拟合圆x^2+y^2+a(1)*x+a(2)*y+a(3)=0
%mode3 用遗传算法，找到一点和一个半径R，各点到这点的距离与R之差的平方和最小
[m,n]= size(edge);
switch mode
case 1
C=sum(edge)/m;
R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;
case 2
A=[edge(:,1) edge(:,2) ones(m,1)];
B=-[edge(:,1).*edge(:,1)+edge(:,2).*edge(:,2)];
a=A\B;
C=-.5*a([1 2])';
R = sqrt((a(1)^2+a(2)^2)/4-a(3));
case 3
save('edge_m','edge','m');
%[x, fval, reason]=ga(fitnessfcn,nvars,A,b,Aeq,beq,LB,UB,nonlcon,options)
C=sum(edge)/m;
R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;
options = gaoptimset('Generations',200,'InitialPopulation',[R,C],...
      'PopulationSize',50,'TolFun',1e-7,'TolCon',1e-7,'MutationFcn',@mutationadaptfeasible );
[sol, fval, exitflag] = ga(@f,3,[],[],[],[],[0,min(edge)],[2*R,max(edge)],[],options);
R=sol(1);
C=sol([2,3]);
fval
end

%适应度函数的matlab代码
function [eval]=f(sol)
load edge_m
R=sol(1);
C=sol([2,3]);
eval=sum((sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2)-R).^2)/m;

%读取.spe文件
%读取.spe文件并显示图像如下面那样调用函数即可
%img=ReadSpe(filename)
%figure;imshow(img);
function [data,data_type] = ReadSpe(filename,startX,endX,startY,endY)
fid=fopen(filename,'r','ieee-le');

[header,count]=fread(fid,4100,'uint8');
dataType=header(109);
xdim=header(43) + header(44)*2^8;
ydim=header(657) + header(658)*2^8;
frames=header(1447) + header(1448)*2^8 +header(1449)*2^16 + header(1450)*2^24;

if ~exist('startX','var')
      startX = 1;
end
if ~exist('endX','var')
      endX=xdim;
end
if ~exist('startY','var')
      startY=1;
end
if ~exist('endY','var')
      endY=ydim;
end
strDataType={'float32','int32','int16','uint16'};
data_type=strDataType{dataType+1};
if (dataType>3)
   fclose(fid);
   fprintf(strcat('Unknown WinSpec data type: ',num2str(dataType)));
   clear data;
   data=[];
   return;
end;
data=zeros([xdim,endY-startY+1,frames]);
dataSize=max((dataType<2)+1)*2;
for z=1:frames
      fseek(fid,4100+dataSize*(xdim*((startY-1)+ydim*(z-1))),'bof');
      [data(1:xdim,1: (endY-startY+1),z),count]=fread(fid,[xdim (endY-startY+1)],strcat(strDataType{dataType+1},'=>',strDataType{dataType+1}));
end;
data=permute(data,[2 1 3]);
data=data(:,startX:endX,: );
fclose(fid);

自动读取spe文件，处理图片，并计算结果

输出文件内容如下：

引用回帖:

6-60 圆心1：( 66，  144) 圆心2：( 1887， 1955)
6-120    圆心1：(  627，  119) 圆心2：( 1405， 1937)

%圆心1坐标
x1=[ 66  627]';
y1=[  144  119]';
%圆心2坐标
x2=[ 1887 1405]';
y2=[ 1955 1937]';

[ Last edited by anyuezhiji on 2010-4-14 at 01:19 ]

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5楼2010-04-13 22:27:05

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adu886886(金币+2, 仿真EPI+1):谢谢认真指导 2010-04-15 08:27

最终修改的程序稍有变化比如滤掉杂点的功能

有兴趣的虫友话可以把它和前面的代码比较
找找有什么不同

CODE:

function Find_CirclesCenter

%%Find Center of circles from picture

%%PSL@CSU

%%QQ:547423688

%%Email:anyuezhiji@qq.com

%%Edit @ 2010.4.14

path='D:\Program Files\MATLAB71\work\CurrentWork\test\';

outfile='CResult.txt';

clear CResult;

n=0;

maxcm=0;

flag=1;

for i=1:720

fname=['8-',num2str(i)];

filename=[fname,'.spe'];  

if exist([path,filename],'file')

   disp(['正在处理',filename]);

   n=n+1;

   [img,dtype]=ReadSpe([path,filename]);

       %figure;imshow(img);

       minp=min(min(img));

       mask=img<3*minp;

       mask = bwmorph(mask,'clean');

       mask = bwmorph(mask,'majority',inf);

   %figure;imshow(mask);

   CResult(n).fname=fname;

   CResult(n).R=[];

   CResult(n).C=[];

   [L,m]=bwlabel(mask);

   %m

   if flag

   for i=1:m

   mask1=mask;

   mask1(find(L~=i))=0;

   BW = edge(uint8(mask1),'sobel');

   %figure,imshow(BW);

   [r,c]=find(BW~=0);

   %eval(['BW',num2str(i),'=BW;']);

   %eval(['edge',num2str(i),'=[r c];']);

   CircleEdge=[r,c];

   [r,center]=findcenter(CircleEdge,2);

   CResult(n).R=[CResult(n).R;round(r)];

   CResult(n).C=[CResult(n).C;round(center([2 1]))];

   end

   if m>maxcm

   maxcm=m;

   end

   CResult(n).num=m;

   [tc,p]=sort(CResult(n).C(:,2));

   CResult(n).C=CResult(n).C(p,:);

   fidout=fopen([path,outfile],'a+'); 

   fprintf(fidout,'%-8s',CResult(n).fname);  

   cc=CResult(n).C;

   for j=1:m

   fprintf(fidout,'\t\t圆心%d：(%5d，%5d)',j,cc(j,1),cc(j,2));

   end

   fprintf(fidout,'\n');  

   fclose(fidout);

   end%end if flag

end

end

if flag

fidout=fopen([path,outfile],'a+');  

fprintf(fidout,'\n');  

fprintf(fidout,'\n');  

for j=1:maxcm

fprintf(fidout,'%%圆心%d坐标\n',j);      

fprintf(fidout,'x%d=[',j);  

for i=1:n

if j<=CResult(i).num

fprintf(fidout,'%5d',CResult(i).C(j,1));

else

fprintf(fidout,'  nan');   

end

end

fprintf(fidout,']'';\n'); 

fprintf(fidout,'y%d=[',j);  

for i=1:n

if j<=CResult(i).num

fprintf(fidout,'%5d',CResult(i).C(j,2));

else

fprintf(fidout,'  nan');   

end

end

fprintf(fidout,']'';\n'); 

end

fprintf(fidout,'\n');  

fprintf(fidout,'\n');  

fclose(fidout);

end%end if flag

function [R,C]=findcenter(edge,mode)

%mode1 相加取中点

%mode2 最小二乘拟合圆x^2+y^2+a(1)*x+a(2)*y+a(3)=0

%mode3 用遗传算法，找到一点和一个半径R，各点到这点的距离与R之差的平方和最小 

[m,n]= size(edge); 

switch mode

    case 1

    C=sum(edge)/m;

    R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;

    case 2

    A=[edge(:,1) edge(:,2) ones(m,1)]; 

    B=-[edge(:,1).*edge(:,1)+edge(:,2).*edge(:,2)]; 

    a=A\B;

    C=-.5*a([1 2])';

    R = sqrt((a(1)^2+a(2)^2)/4-a(3));   

    case 3

    save('edge_m','edge','m');

    %[x, fval, reason]=ga(fitnessfcn,nvars,A,b,Aeq,beq,LB,UB,nonlcon,options)

    C=sum(edge)/m;

    R=sum(sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2))/m;

    options = gaoptimset('Generations',200,'InitialPopulation',[R,C],...

        'PopulationSize',50,'TolFun',1e-7,'TolCon',1e-7,'MutationFcn',@mutationadaptfeasible );

    [sol, fval, exitflag] = ga(@f,3,[],[],[],[],[0,min(edge)],[2*R,max(edge)],[],options);  

    R=sol(1);

    C=sol([2,3]);

    fval

end        

%适应度函数的matlab代码 

function [eval]=f(sol) 

load edge_m

R=sol(1);

C=sol([2,3]);

eval=sum((sqrt((edge(:,1)-C(1)).^2+(edge(:,2)-C(2)).^2)-R).^2)/m;

%读取.spe文件

function [data,data_type] = ReadSpe(filename,startX,endX,startY,endY)

   fid=fopen(filename,'r','ieee-le');

   [header,count]=fread(fid,4100,'uint8');

   dataType=header(109);

   xdim=header(43) + header(44)*2^8;

   ydim=header(657) + header(658)*2^8;

   frames=header(1447) + header(1448)*2^8 +header(1449)*2^16 + header(1450)

*2^24;

    if ~exist('startX','var') 

          startX = 1; 

    end

    if ~exist('endX','var') 

          endX=xdim;

    end

    if ~exist('startY','var') 

          startY=1;

    end

    if ~exist('endY','var') 

          endY=ydim;

    end

   strDataType={'float32','int32','int16','uint16'};

   data_type=strDataType{dataType+1};

   if (dataType>3)

      fclose(fid);

      fprintf(strcat('Unknown WinSpec data type: ',num2str(dataType)));

      clear data;

      data=[];

      return;

   end;

   data=zeros([xdim,endY-startY+1,frames]);

   dataSize=max((dataType<2)+1)*2;

   for z=1:frames

         fseek(fid,4100+dataSize*(xdim*((startY-1)+ydim*(z-1))),'bof');

         [data(1:xdim,1:(endY-startY+1),z),count]=fread(fid,[xdim (endY-startY+1)],strcat(strDataType{dataType+1},'=>',strDataType{dataType+1}));

   end;

   data=permute(data,[2 1 3]);

   data=data(:,startX:endX,:);

   fclose(fid);

[ Last edited by anyuezhiji on 2010-4-14 at 21:07 ]

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回复此楼

暗月下没有留下风的痕迹，但它已经寂然飘逝。。By&amp;lt;暗月之寂&amp;gt;:tiger38:

6楼2010-04-14 21:03:47

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