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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【讨论】求教Gromacs软件TOP文件的生成
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kjl3283

铜虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】求教Gromacs软件TOP文件的生成 已有2人参与

请教大侠，我是使用Gromacs软件，现在有有gro文件或者PDB文件，想获得top文件，我利用pdb2gmx命令，但是软件不识别其中原子（如氮化硼纳米管），有什么好的办法可以获得top文件吗？Sample Text
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纳米器件设计
1楼 2010-04-16 20:57:35
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kjl3283

铜虫 (小有名气)
也就是在gromacs里面把，残基的信息加上去吗？？
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纳米器件设计
3楼2010-04-18 11:29:06
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-17 13:46
选择你要用的力场，在rtp文件里加入你的残基信息
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2楼2010-04-17 12:08:05
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-18 22:23
就是改你要用力场的相应的rtp文件
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4楼2010-04-18 19:10:07
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