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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Turbomole/ORCA » 【求助】turbomole并行的问题
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sikasun

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】turbomole并行的问题 已有5人参与

我刚开始接触这个软件，因为要计算的分子比较大，想用几个核同时进行一个计算。我在.bashcr文件里加了
export PARA_ARCH=MPI
export PATH=$TURBODIR/bin/i786-pc-linux-gnu_mpi:$PATH
export PARNODES=4
export TURBOTMPDIR=/scratch/bht/
source以后进行计算，总有下面的错误（没改之前用一个核算没有问题）
   MPI Application rank 1 exited before MPI_Finalize() with status 13
       forrtl:error(78):process killed(SIGTEKM)
                       。
                       。
                       。
因为我对linux系统不是很熟悉，请回帖的人尽量把步骤说的详细些，先谢谢大家了。
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1楼 2010-04-16 13:13:56
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
sikasun(金币+10):谢谢，你说的我不太明白，但是我记下来了，我决定学学linux以后再来解决这个并行的问题，呵呵，先用一个核算着吧。不过很感谢大家，终于有人理我了，能我明白一点了以后再问问题吧。 2010-04-27 10:30
请先确认你已经正确安装了mpich。
然后到job.last job.1 nohup.out找一下看还有没有其他的报错信息。
引用回帖:
Originally posted by sikasun at 2010-04-16 13:13:56:
我刚开始接触这个软件，因为要计算的分子比较大，想用几个核同时进行一个计算。我在.bashcr文件里加了
export PARA_ARCH=MPI
export PATH=$TURBODIR/bin/i786-pc-linux-gnu_mpi:$PATH
export PARNODES=4
expo ...

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9楼2010-04-26 18:56:49
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sikasun

木虫 (正式写手)
★
aylayl08(金币+1):感谢提示 2010-04-20 17:44
heyo_123: 2010-04-26 16:58
网上有人说这个错误是内存不够，具体再改就不知道了
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3楼2010-04-16 14:54:12
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阳光_aini

好东东转来分享一下！

sikasun(金币+1):谢谢，虽然看不明白 2010-04-27 10:24
并行软件
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来源：http://www.paratera.com
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6楼2010-04-26 17:52:30
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阳光_aini

不知是否有用，试试！
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7楼2010-04-26 17:53:14
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