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michaelchen

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】求助二次PCR问题 已有1人参与

最近小弟通过RT-PCR扩增我的目的片段1.5kb并进行测序,由于该基因低丰度表达,量很少,但克隆前提又不能扩增大于30个循环。所以用了半巢式pcr来做,但二次pcr后扩增的结果是拖尾严重,有不少非特异性扩增,能看到目的片段但也很弱,而且浓度稀释后的都差不多(1,1/10, 1/50,1/100).1/100稀释后后什么都没有了。
请问有谁能告诉我如何优化吗?拖尾的问题如何解决?还有如何这样直接切胶会影响后续的基因重组吗》?谢谢!
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+3): 2010-04-16 11:54
可以考虑将第一次的产物,在目的片段处切胶回收后,再进行二次PCR,这样扩增肯定会减少非特异性扩增。
另外,PCR程序升高三度,然后前五个循环使用降落,每循环降一度,效果肯定会有一定程度的改善。
2楼2010-04-16 11:15:25
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