24小时热门版块排行榜    

查看: 1557  |  回复: 27

qasd

木虫 (著名写手)


574384607(金币+2): 2010-05-02 08:57
zzy870720z(金币+1):感谢建议 2010-05-09 15:42:20
改NPT,可能初态不太合理
11楼2010-05-01 19:13:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Tower.Tsu

金虫 (著名写手)

574384607(金币+2): 2010-05-02 08:58
我也经常遇到这个问题,原子数目比较多时,或者NVT温度设置过高时都出现这个问题。想知道造成这个的原因。是因为数值计算过程中误差累积导致病态?
不再是一个人,处处时时想着念着的都是我们...
12楼2010-05-02 01:58:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-05-01 19:13:40:
改NPT,可能初态不太合理

好的,谢谢。我试试看看
13楼2010-05-02 08:58:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by Tower.Tsu at 2010-05-02 01:58:53:
我也经常遇到这个问题,原子数目比较多时,或者NVT温度设置过高时都出现这个问题。想知道造成这个的原因。是因为数值计算过程中误差累积导致病态?

原子数目确实比较多,我也在这问了老多天啦,没什么进展
14楼2010-05-02 09:00:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangnana

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
xiaohunhun(金币+3):谢谢 2010-05-04 19:02:46
574384607(金币+3): 2010-05-05 07:49:28
我想问一下你的结构已优化收敛了,这个错误的结果是从何而来
顺便说一下,我也出现过这个错误,是在Discover-Dynamic后出现的,
解决办法:先用minmize优化,使能量降低,然后再用Dynamic就好了
原因:结构不太合理,比如两个原子离的太近,直接做Dynamic某些原子会因为受力太大,在下一刻不知跑到哪里去了,造成模拟上的不稳定。如出现上述错误,说明你的体系需要充分的Minemize
我始终相信球上则居中,求中则居下,求稳则完蛋
15楼2010-05-04 16:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huangnana at 2010-05-04 16:42:50:
我想问一下你的结构已优化收敛了,这个错误的结果是从何而来
顺便说一下,我也出现过这个错误,是在Discover-Dynamic后出现的,
解决办法:先用minmize优化,使能量降低,然后再用Dynamic就好了
原因:结构不太 ...

当然也是在Discover-Dynamic后出现的,用minmize优化,我的是在优化收敛了之后也可能出现啊,我怀疑可能是跟摆放位置也有关
16楼2010-05-05 09:42:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangnana

木虫 (小有名气)

574384607(金币+1): 2010-05-06 07:55:33
是啊,手动摆放肯定有不合理的地方
我始终相信球上则居中,求中则居下,求稳则完蛋
17楼2010-05-05 16:40:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bjtu

木虫 (小有名气)

574384607(金币+1): 2010-05-06 07:55:22
仔细读读使用手册,应该可以解决
18楼2010-05-05 18:56:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huangnana at 2010-05-05 16:40:37:
是啊,手动摆放肯定有不合理的地方

我只会手动放置,还能有别的放法吗?我只是能通过图像用眼睛估计着大体调到中间,我刚学,还请指点一下啊
19楼2010-05-06 07:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangnana

木虫 (小有名气)


zzy870720z(金币+1):感谢交流 2010-05-09 15:42:54
有的必须使用手动摆放,但是有的可以自动生成
在help里有个例子你看一下有没有帮助,这个是自动生成的
Help-Tutorials-Discover里面,这个主要是聚合物和表面的,不知你要做那方面啊
我始终相信球上则居中,求中则居下,求稳则完蛋
20楼2010-05-06 08:18:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 574384607 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 081700 调剂 267分 +7 迷人的哈哈 2026-03-23 7/350 2026-03-23 23:19 by 星空星月
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +5 jiajunX 2026-03-22 5/250 2026-03-23 18:07 by YMU施老师
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 一志愿华中科技大学071000,求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 生物学调剂招人!!! +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
信息提示
请填处理意见