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汕头大学海洋科学接受调剂
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qasd

木虫 (著名写手)
★
574384607(金币+2): 2010-05-02 08:57
zzy870720z(金币+1):感谢建议 2010-05-09 15:42:20
改NPT，可能初态不太合理
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11楼2010-05-01 19:13:40
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Tower.Tsu

金虫 (著名写手)
574384607(金币+2): 2010-05-02 08:58
我也经常遇到这个问题，原子数目比较多时，或者NVT温度设置过高时都出现这个问题。想知道造成这个的原因。是因为数值计算过程中误差累积导致病态？
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不再是一个人，处处时时想着念着的都是我们...
12楼2010-05-02 01:58:53
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574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-05-01 19:13:40:
改NPT，可能初态不太合理

好的，谢谢。我试试看看
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13楼2010-05-02 08:58:04
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574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by Tower.Tsu at 2010-05-02 01:58:53:
我也经常遇到这个问题，原子数目比较多时，或者NVT温度设置过高时都出现这个问题。想知道造成这个的原因。是因为数值计算过程中误差累积导致病态？

原子数目确实比较多，我也在这问了老多天啦，没什么进展
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14楼2010-05-02 09:00:14
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huangnana

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
xiaohunhun(金币+3):谢谢 2010-05-04 19:02:46
574384607(金币+3): 2010-05-05 07:49:28
我想问一下你的结构已优化收敛了，这个错误的结果是从何而来
顺便说一下，我也出现过这个错误，是在Discover-Dynamic后出现的，
解决办法:先用minmize优化，使能量降低，然后再用Dynamic就好了
原因：结构不太合理，比如两个原子离的太近，直接做Dynamic某些原子会因为受力太大，在下一刻不知跑到哪里去了，造成模拟上的不稳定。如出现上述错误，说明你的体系需要充分的Minemize
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我始终相信球上则居中，求中则居下，求稳则完蛋
15楼2010-05-04 16:42:50
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574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by huangnana at 2010-05-04 16:42:50:
我想问一下你的结构已优化收敛了，这个错误的结果是从何而来
顺便说一下，我也出现过这个错误，是在Discover-Dynamic后出现的，
解决办法:先用minmize优化，使能量降低，然后再用Dynamic就好了
原因：结构不太 ...

当然也是在Discover-Dynamic后出现的，用minmize优化，我的是在优化收敛了之后也可能出现啊，我怀疑可能是跟摆放位置也有关
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16楼2010-05-05 09:42:45
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huangnana

木虫 (小有名气)
574384607(金币+1): 2010-05-06 07:55:33
是啊，手动摆放肯定有不合理的地方
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我始终相信球上则居中，求中则居下，求稳则完蛋
17楼2010-05-05 16:40:37
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bjtu

木虫 (小有名气)
574384607(金币+1): 2010-05-06 07:55:22
仔细读读使用手册，应该可以解决
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18楼2010-05-05 18:56:11
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574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by huangnana at 2010-05-05 16:40:37:
是啊，手动摆放肯定有不合理的地方

我只会手动放置，还能有别的放法吗？我只是能通过图像用眼睛估计着大体调到中间，我刚学，还请指点一下啊
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19楼2010-05-06 07:58:40
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huangnana

木虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1):感谢交流 2010-05-09 15:42:54
有的必须使用手动摆放，但是有的可以自动生成
在help里有个例子你看一下有没有帮助，这个是自动生成的
Help-Tutorials-Discover里面，这个主要是聚合物和表面的，不知你要做那方面啊
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我始终相信球上则居中，求中则居下，求稳则完蛋
20楼2010-05-06 08:18:51
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