应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】autodock 求助
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1030  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 lanying 的 3 个金币

lanying

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】autodock 求助 已有3人参与

各位大大，帮忙啊！
我做对接时遇到的一个问题，机器提示错误：
autogrid4: ERROR:  Too many atoms in receptor PDBQT file macro.pdbqt;
autogrid4: ERROR:  -- the maximum number of atoms, AG_MAX_ATOMS, allowed is 32768.
autogrid4: ERROR:  Sorry, AutoGrid cannot continue.
怎么解决啊
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-04-15 10:50:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★
lanying(金币+1): 2010-04-15 14:52
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-15 16:39
原子数太多了, 删除一些非关键部位的原子的
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-04-15 11:33:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)
★
lanying(金币+1): 2010-04-15 14:52
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-15 16:39
离Grid Box比较远的都可以删掉，直接选中box中心某一个距离意外的残基，全部删除就好了……
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-04-15 14:34:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lanying

新虫 (初入文坛)
我已经删了一些残基，试过了是可行的，谢谢了。就是想再问一下，有没有其他的方法，比如可不可以通过修改内核定义的原子数的上限达到同样的目的。
赞一下 回复此楼
4楼2010-04-15 14:55:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-15 16:39
引用回帖:
Originally posted by lanying at 2010-04-15 14:55:30:
我已经删了一些残基，试过了是可行的，谢谢了。就是想再问一下，有没有其他的方法，比如可不可以通过修改内核定义的原子数的上限达到同样的目的。

关于内核方面的问题不太清楚……但既然设置了这个上限，感觉上是有原因的吧，可能超过上限会出现未知错误影响结果，建议上autodock的主页去问一下
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-04-15 15:19:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lanying 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085602调剂 初试总分335 +8 19123253302 2026-04-05 8/400 2026-04-05 20:44 by 南航~万老师
[考研] 296求调剂 +3 汪！？！ 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:13 by 啵啵啵0119
[考研] 329求调剂 +17 miaodesi 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 18:33 by 蓝云思雨
[考研] 326求调剂 +3 顾若浮生 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:32 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +6 cs0106 2026-04-05 6/300 2026-04-05 16:34 by imissbao
[考研] 085600调剂 +9 东照照照 2026-04-04 9/450 2026-04-05 13:44 by ujn_zhuj
[考研] 求调剂 +4 wos666 2026-04-03 4/200 2026-04-05 11:48 by arrow8852
[考研] 271分求调剂学校 +12 zph158488！ 2026-04-02 13/650 2026-04-05 10:13 by lqwchd
[考研] 材料化工306分找合适调剂 +14 沧海轻舟e 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:53 by 朱云虎202
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考研] 282求调剂 +20 ycy1201 2026-04-01 22/1100 2026-04-04 00:42 by userper
[考研] 357求调剂 +13 1050389037 2026-04-03 13/650 2026-04-03 22:27 by 无际的草原
[考研] 生物学硕341求调剂 +4 你笑起来像云朵 2026-04-03 4/200 2026-04-03 10:32 by macy2011
[考研] 286求调剂 +7 Faune 2026-03-30 7/350 2026-04-03 10:14 by linyelide
[考研] 274求调剂 +10 薛定谔的虎。 2026-04-01 10/500 2026-04-03 10:13 by tianyyysss
[考研] 一志愿山东大学化学与化工学院材料与化工专硕，360分求调剂 +4 不愿透露姓名的� 2026-04-02 4/200 2026-04-03 09:29 by 遗忘消失的灆
[考研] 085600，320分求调剂 +6 大馋小子 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:54 by dongzh2009
[考研] 一志愿北京科技材料科学与工程288分，求调剂 +14 是辰啊 2026-04-02 14/700 2026-04-02 21:10 by dongzh2009
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
[考研] 348环境工程调剂 +3 吴彦祖24k 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:14 by nanaliuyun
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭