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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】请教版内第一原理动力学模拟真的比经典MD好吗
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liuguan

金虫 (著名写手)

计算蠕虫
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-14 11:45
cathy-zhang7777(金币+1):非常感谢!其实我之前一直做第一原理的,但是现在要研究一些变温的性质,所以求助于MD.还有一个问题就是温度和压强都是飘的,那怎么研究在特定TP下的性质 2010-04-15 10:52
其实我们在认识一个软件的作用时候，我们要充分认识它的优点和缺点，不应该片面的说有共同用处的软件那个优劣。。。可能只是它在某方面有长处啦。。。拙见！
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11楼2010-04-14 11:18:29
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 呵呵 我倒是希望经典MD不光是被CPMD追着跑 除了尺度还要在其他方面领跑 2010-04-14 11:47
cathy-zhang7777(金币+2):谢谢bay, 其实我之前一直做第一原理的,但是现在要研究一些变温的性质,所以求助于MD.我算的冰晶胞很小,但是第一原理MD就已经跑得很慢了.还有一个问题就是温度和压强都是飘的,那怎么研究在特定TP下的性质 2010-04-15 10:49
就像问量子力学好还是统计力学好一样, 问题的切入点不一样, 关注的层次不一样, 是无法进行比较的. 只能问, 对于一个具体的课题, 第一原理MD 好还是经典MD 好.
经典MD 处理的原子数远比CPMD 大, 过几年CPMD 也能处理今天的经典MD 的体系时候, 经典MD 早就跑到更前面的地方去了
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12楼2010-04-14 11:34:38
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
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lei0736(金币+4):谢谢 2010-04-14 13:55
cathy-zhang7777(金币+1):非常感谢虎王.其实我之前一直做第一原理的.还有一个问题就是温度和压强都是飘的,那怎么研究在特定TP下的性质 2010-04-15 10:51
经典模拟有一条可能是第一原理没有办法做到的，就是它可以研究一个不存在的假想的模型力场。Frenkel的书里不是说了吗？一个只存在强排斥而没有任何吸引力的粒子体系可否形成晶体？这个问题只能用经典模拟方法来研究，因为它本身就是一个经典力学问题。类似地，比如“LJ流体的性质与相变”这样的问题也只能在经典模拟范围里解决。

所以说，就算计算机快得没有办法了，第一原理可以大规模计算了，经典模拟方法也完全可能有着它存在的价值和继续发展的前景，就看你提出的是什么问题。
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13楼2010-04-14 13:48:00
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cathy-zhang7777

禁虫 (正式写手)
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14楼2010-04-15 13:18:14
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
cathy-zhang7777(金币+1): 2010-04-15 15:13
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-15 16:37
”飘的“，是什么意思？在统计热力学当中，微观体系中的任何热力学量都是有起伏的，而不是固定的。宏观表现出来的观测值是其统计平均的结果。
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15楼2010-04-15 14:23:57
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cathy-zhang7777

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
16楼2010-04-15 15:12:45
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老虎大王

木虫 (著名写手)
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lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-15 16:37
你搞MD，必须要取平均的。不然不叫MD了。这个工作量小得很，极微小的工作。编一个很简单的小程序就可以。也可以用Grep、Awk等提取数据，然后用Excel等软件来求平均。
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17楼2010-04-15 15:16:31
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞
★ ★
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lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-16 20:45
cathy-zhang7777(金币+2):谢谢～～ 2010-04-17 14:06
引用回帖:
Originally posted by cathy-zhang7777 at 2010-04-12 15:38:17:
经典动力学由固定的forcefield而来 速度很快 像compass等力场也是有第一原理得来的
而第一原理动力学太耗时，我的硬件负担不起
固有此问：第一原理动力学真的比经典动力学好吗
其实我之前一直做第一原理的,但是 ...

一般来说，由于经典的势是需要拟合的，所以有时候没有第一性原理的准。
没办法，没资源根本就不可能搞第一性分子动力学。
很可能你的模拟的胞太小。
T和P求平均就可以。用NPT系综就可以。
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真理是一点点接近的！
18楼2010-04-16 17:21:29
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