24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 877  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hurry78

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Justsoso

至尊木虫 (著名写手)


帝夫(金币+1): 2010-04-18 17:16
hurry78(金币+5):谢谢你的详细解答 2010-04-19 11:53
引用回帖:
Originally posted by hurry78 at 2010-04-15 23:03:34:
能详细一些吗?如何操作,我搜索了很多论坛,没有相关的材料

几次遇到类似的问题是所有原子一起做各向异性,就会出现如上提示;这时应在ANIS后加一个参数,比如 “anis n”,先对之后的n个原子做各向异性,一般都不会再有问题,下一轮的时候就逐步再进行,直至完成。

同样搜索了一下,网上大部分推荐用BLOC命令(链接附后),你也可以试一下。

--------------------------
http://15151.5d6d.com/redirect.php?tid=4854&goto=lastpost
用 BLOC 命令把原子分成若干个BLOC即可refine.
出现问题是因为要refine的参数太多。
BLOC 的使用可参见Shelxtl manual.

--------------------------
http://www.msg.ucsf.edu/local/programs/shelxl/HELP13.html
13.    The final step: getting esds, etc. using L.S. - why doesn't it work?

So, you want to use L.S. and get this structure finished.  But when you do, your job crashes after less than a minute and the output file has this cryptic message:

** ARRAY B TOO SMALL FOR THIS PROBLEM **

What the heck is Array B?!  Fear not.

In Chapter 2.6 of the handbook, this problem is addressed.  It says,

"For both L.S. and CGLS options, it is possible to block the refinement so that a different combination of
parameters is refined each cycle. For example after a large structure has been refined using CGLS (without
BLOC), a final job may be run with L.S. 1, DAMP 0 0 and BLOC 1 (or e.g. BLOC N_1 > LAST for a protein)
to obtain esds on all geometric parameters; the anisotropic displacement parameters are held fixed, reducing the
number of parameters by a factor of three and the cycle time by an order of magnitude."

Voila!  You're ready to publish!
GutenTag.
7楼2010-04-18 16:15:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

hurry78

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

2楼2010-04-12 09:32:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

etongtong

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
wsht212(金币+1):谢谢交流 2010-04-12 11:46
hurry78(金币+5):没有在shelxtl下解决的方法吗?用xh的非正定性原子过多,处理起来相当麻烦 2010-04-12 12:48
hurry78(金币+5):我的原子也不多,才一百多个,为何也如此呢? 2010-04-12 12:51
wsht212(金币+1): 2010-04-19 20:38
这个跟编程有关,SHELXTL是fonture编程,有位数的限定,在XL时,同时精修的参数不能超过一定量,好像是1000。
为了精修一些大分子,如CD等,可以用子程序XH来算,不过你的计算机要好,
不然算一遍也的好几个小时。

[ Last edited by etongtong on 2010-4-12 at 11:54 ]
▄︻┻┳═一................................................
3楼2010-04-12 11:37:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hurry78

禁虫 (小有名气)

wsht212:LZ开始上路别太着急,慢慢来会不断有收获的 2010-04-15 22:19
本帖内容被屏蔽

4楼2010-04-12 22:12:28
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[高分子] 环氧灌封胶 抗沉剂 +3 huagong159 2026-04-03 3/150 2026-04-09 17:11 by wei12shua
[考研] 一志愿中国科学院上海有机所,有机化学356分找调剂 +8 Nadiums 2026-04-09 8/400 2026-04-09 17:01 by luoyongfeng
[考研] 一志愿电子科技大学085600材料与化工 329分求调剂 +14 Naiko 2026-04-04 14/700 2026-04-09 16:56 by luoyongfeng
[考研] 265求调剂 +4 风说她早忘了 2026-04-07 4/200 2026-04-09 13:59 by only周
[考研] 334求调剂 +16 Riot2025 2026-04-08 17/850 2026-04-09 09:28 by wdyheheeh
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
[考研] 283求调剂 +19 A child 2026-04-04 19/950 2026-04-08 14:26 by xingguangj
[考研] 求材料调剂,一志愿郑州大学289分 +21 硕星赴 2026-04-03 21/1050 2026-04-08 11:55 by 猪会飞
[考研] 求调剂 +28 111623 2026-04-04 33/1650 2026-04-08 09:24 by 泽润东方
[考研] 一志愿郑州大学材料与化工085600,求调剂 +34 吃的不少 2026-04-02 34/1700 2026-04-07 20:01 by lrll?l
[考研] 085405软件工程301分求调剂,专硕可跨专业,四六级已过 +3 静静想想 2026-04-05 3/150 2026-04-06 15:23 by nepu_uu
[考研] 315求调剂 +5 &123456789 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:55 by nepu_uu
[考研] 材料调剂 +13 一样YWY 2026-04-03 14/700 2026-04-05 18:20 by 蓝云思雨
[考研] 考研调剂生寻找导师 +3 顾瞻考研啊 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:18 by 啵啵啵0119
[考研] 可跨专业调剂 +3 周的得地 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:21 by barlinike
[考研] 0854求调剂 +4 assdll 2026-04-03 4/200 2026-04-04 22:17 by hemengdong
[考研] 342求调剂 +3 Liang7111 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:47 by dongzh2009
[考研] 一志愿重庆大学085404,总分314分,求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 320求调剂 +5 振—TZ 2026-04-02 5/250 2026-04-03 14:42 by fxue1114
[考研] 330求调剂 +3 白神呜呼呼 2026-04-02 3/150 2026-04-03 10:15 by 蓝云思雨
信息提示
请填处理意见