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panshf

金虫 (正式写手)

[交流] 已完结【求助】关于MS中构建聚合物结构的问题已有2人参与

我刚接触MS,现在想构建一条有机聚合物链,请问如果是纤维素类的怎么构建其结构呢?还有边界条件如何设置呢?麻烦能给出详细点儿的步骤,谢谢了

[ Last edited by panshf on 2010-5-27 at 16:46 ]
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qasd

木虫 (著名写手)


panshf(金币+1): 2010-04-09 19:11
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-10 10:11
build polymer里看看有没有你需要的单体,没有先画单体
2楼2010-04-09 18:06:21
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panshf

金虫 (正式写手)

我画了单体了,然后我把头尾的原子选好,优化的时候总是出错,说是有两个原子的坐标什么的出错,不知道怎么搞的,所以我想有没有其他的方法构建单体
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3楼2010-04-09 19:10:46
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qasd

木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-10 13:17
优化时出错?也就是建立成功了?
4楼2010-04-10 12:28:39
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panshf

金虫 (正式写手)

是啊,单体构建好了,优化的时候我想选择pcff力场,可是优化老是出错,说是那俩原子的立场类型错误,不知道该怎么改呢。我接下来要用的就是pcff力场
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5楼2010-04-10 14:41:07
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
panshf(金币+1): 2010-04-11 10:44
panshf(金币+3): 2010-04-11 10:45
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-11 11:05
哦,那是MS自动分配时不能正确识别,手动指定原子的力场类型就好了
6楼2010-04-11 10:14:12
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panshf

金虫 (正式写手)

谢谢你给我做的回答,还想问问就是我要设置边界条件,怎么设置呢?在哪个模块啊?
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7楼2010-04-11 10:55:14
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qasd

木虫 (著名写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-11 18:16
panshf(金币+1): 2010-04-11 19:30
panshf(金币+1): 2010-04-14 21:24
PBC么?用AC模块就行了
8楼2010-04-11 17:44:18
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panshf

金虫 (正式写手)

那请问具体要设置哪些参数呢?您能不能帮我介绍详细一些呀?
在Amorphous Cell里的哪设置呢?
谢谢
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9楼2010-04-11 19:35:02
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