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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】用Forcite分析MSD的问题，急
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[交流] 【求助】用Forcite分析MSD的问题，急 已有4人参与

模拟甲烷的扩散，用的是NPT及COMPASS力场，在Forcit模块运行Dynamic后，分析甲烷分子的MSD，相同的构型相同的参数，两次运算的结果相差很大，问各位大侠，这是什么原因啊？有什么好的建议？？？万分感谢。
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1楼 2010-04-04 17:44:36
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢! 2010-04-04 19:27
用UFF看看？你是做甲烷在什么里面的扩散？
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
2楼2010-04-04 17:45:41
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qasd

木虫 (著名写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢! 2010-04-04 19:27
做MSD用NPT？
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3楼2010-04-04 19:08:14
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+2):谢谢! 2010-04-04 19:26
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-04-04 19:08:14:
做MSD用NPT？

是啊，据我所知，一般是NVT吧，如果设置相同，跑出来的MSD应该不会差很多，如果跑的时间很长，应该就很接近了。
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4楼2010-04-04 19:21:06
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gaoymatrix

木虫 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-04-04 21:13
用NVT
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高调做事，低调做人
5楼2010-04-04 20:05:35
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