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anny66cb

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】克隆一个葡萄品种的基因,可以以另一个品种的序列设计引物吗已有1人参与

我要克隆一个葡萄品种的某个基因,可以直接跟据另一个葡萄品种的序列设计引物吗设计时要注意什么吗? 会不会有单个位点差异的影响

[ Last edited by anny66cb on 2010-3-31 at 20:30 ]
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)


amisking(金币+1): 2010-03-31 21:41
anny66cb(金币+1): 2010-03-31 23:15
可以选择基因的保守区进行引物设计,不敢保证没有序列发生变化。
2楼2010-03-31 21:38:05
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临风7071

木虫 (正式写手)

anny66cb(金币+1): 2010-03-31 23:15
在NCBI上查找葡萄该基因的保守序列,设计引物,在你的葡萄品种中扩增出该基因的部分片段,测序,然后根据测的的序列设计引物,用RACE扩增全长的基因,不过这个耗时是相当常的
3楼2010-03-31 22:17:21
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anny66cb

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 临风7071 at 2010-03-31 22:17:21:
在NCBI上查找葡萄该基因的保守序列,设计引物,在你的葡萄品种中扩增出该基因的部分片段,测序,然后根据测的的序列设计引物,用RACE扩增全长的基因,不过这个耗时是相当常的

葡萄中这个基因只有一个品种中有,难道要我查找其他物种的设计简并引物吗?那个好像太麻烦了,我只要基因的部分序列,不用全长的
4楼2010-03-31 23:15:23
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yucheng9255

木虫 (著名写手)

根据已知品种的序列可以试试,不行的话,换个位置,多试几次,肯定没问题的
5楼2010-03-31 23:20:24
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临风7071

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yucheng9255 at 2010-03-31 23:20:24:
根据已知品种的序列可以试试,不行的话,换个位置,多试几次,肯定没问题的

同意楼上的说法
6楼2010-03-31 23:41:24
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rkrl001

木虫 (正式写手)

可以试试,一般同源性在95%以上
7楼2010-04-06 13:57:08
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