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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】克隆一个葡萄品种的基因，可以以另一个品种的序列设计引物吗
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anny66cb

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】克隆一个葡萄品种的基因，可以以另一个品种的序列设计引物吗 已有1人参与

我要克隆一个葡萄品种的某个基因，可以直接跟据另一个葡萄品种的序列设计引物吗？ 设计时要注意什么吗？ 会不会有单个位点差异的影响

[ Last edited by anny66cb on 2010-3-31 at 20:30 ]
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1楼 2010-03-31 20:28:20
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)
★
amisking(金币+1): 2010-03-31 21:41
anny66cb(金币+1): 2010-03-31 23:15
可以选择基因的保守区进行引物设计，不敢保证没有序列发生变化。
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2楼2010-03-31 21:38:05
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临风7071

木虫 (正式写手)
anny66cb(金币+1): 2010-03-31 23:15
在NCBI上查找葡萄该基因的保守序列，设计引物，在你的葡萄品种中扩增出该基因的部分片段，测序，然后根据测的的序列设计引物，用RACE扩增全长的基因，不过这个耗时是相当常的
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3楼2010-03-31 22:17:21
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anny66cb

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 临风7071 at 2010-03-31 22:17:21:
在NCBI上查找葡萄该基因的保守序列，设计引物，在你的葡萄品种中扩增出该基因的部分片段，测序，然后根据测的的序列设计引物，用RACE扩增全长的基因，不过这个耗时是相当常的

葡萄中这个基因只有一个品种中有，难道要我查找其他物种的设计简并引物吗？那个好像太麻烦了，我只要基因的部分序列，不用全长的
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4楼2010-03-31 23:15:23
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yucheng9255

木虫 (著名写手)
根据已知品种的序列可以试试，不行的话，换个位置，多试几次，肯定没问题的
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5楼2010-03-31 23:20:24
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临风7071

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yucheng9255 at 2010-03-31 23:20:24:
根据已知品种的序列可以试试，不行的话，换个位置，多试几次，肯定没问题的

同意楼上的说法
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6楼2010-03-31 23:41:24
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rkrl001

木虫 (正式写手)
可以试试，一般同源性在95%以上
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7楼2010-04-06 13:57:08
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