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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta中的anneal如何实现？
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yangjun102

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】siesta中的anneal如何实现？ 已有4人参与

我想用siesta退火法做一下能量最小，但不清楚怎么实现？请高手指点。
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1楼 2010-03-31 12:18:29
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yangjun102

银虫 (小有名气)

请高手指点下吧？
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2楼2010-04-02 14:20:35
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smartly

金虫 (小有名气)
你会了吗？？
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3楼2010-11-29 14:12:14
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wangsong1016

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zzy870720z(金币+1):鼓励交流 2010-11-29 22:26:13
我不清楚你说的用退火做能量最小是什么意思。不过如果要找一个体系的能量最小值，用结构优化里面的CG或者其他的模块可以做。就是找一个体系的能量最低值。退火感觉上是从降温的过程，如果降温的速度比较快，有可能让体系出现亚稳态。也许不能得到能量最低状态。

    仅供参考
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4楼2010-11-29 15:30:25
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smartly

金虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-12-03 14:00:59
引用回帖:
Originally posted by wangsong1016 at 2010-11-29 15:30:25:
我不清楚你说的用退火做能量最小是什么意思。不过如果要找一个体系的能量最小值，用结构优化里面的CG或者其他的模块可以做。就是找一个体系的能量最低值。退火感觉上是从降温的过程，如果降温的速度比较快，有可能 ...

用CG做，只能得到local minimum。退火貌似可以找到global minimum
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5楼2010-12-03 10:29:14
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wangsong1016

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引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-12-03 10:29:14:


用CG做，只能得到local minimum。退火貌似可以找到global minimum

这个我就不懂了。你能具体说一下吗，什么是local minimun，什么是global minimun，两者有什么区别。比如一个菱形的石墨烯超晶格，5*5一共50个原子，local与global minimum分别表示的是什么意思，谢谢！
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6楼2010-12-03 15:54:38
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smartly

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mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-12-05 12:47:45
引用回帖:
Originally posted by wangsong1016 at 2010-12-03 15:54:38:



这个我就不懂了。你能具体说一下吗，什么是local minimun，什么是global minimun，两者有什么区别。比如一个菱形的石墨烯超晶格，5*5一共50个原子，local与global minimum分别表示的是什么意思，谢谢！

比如一个体系可能有几种稳定存在的构型啊，他们都是能量局域最低，其中能量最低的构型是最稳定的，是全局能量最低。。。
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7楼2010-12-05 11:56:54
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goldenfisher

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sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-05 17:25:59
退火应该是在分子动力学中实现的。貌似你必须自己编程搞定。
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8楼2010-12-05 17:09:50
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wangsong1016

铜虫 (初入文坛)
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引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-12-05 11:56:54:



比如一个体系可能有几种稳定存在的构型啊，他们都是能量局域最低，其中能量最低的构型是最稳定的，是全局能量最低。。。

哦，明白一些了，谢谢！
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9楼2010-12-06 08:55:12
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yangjun102

银虫 (小有名气)
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youzhizhe(金币+2):谢谢交流。链接貌似传重复了一份。 2010-12-09 17:30:00
引用回帖:
Originally posted by yangjun102 at 2010-03-31 12:18:29:
我想用siesta退火法做一下能量最小，但不清楚怎么实现？请高手指点。

首先将体系升高到一个比较高的温度，这时原子可以在整个体系内随机运动，然后降温，降温的过程必须非常的缓慢，以便使体系找到全局的最小能量点。
传一篇文献，供大家参考。


http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=103527532z8z0657gw1f87er
http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=103527532z8z0657gw1f87er
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10楼2010-12-09 16:29:32
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